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Identificación y caracterización a nivel genómico de la familia de genes LACS sensible al estrés abiótico en soja ()

Autores: Wang, Jie; Li, Xiaoxue; Zhao, Xunchao; Na, Chen; Liu, Hongliang; Miao, Huanran; Zhou, Jinghang; Xiao, Jialei; Zhao, Xue; Han, Yingpeng

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2022

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Acceso abierto

Artículo científico
2022

Identificación y caracterización a nivel genómico de la familia de genes LACS sensible al estrés abiótico en soja ()


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Agronomía y Ciencia de los Cultivos

Palabras clave

Long-chain acyl-CoA synthases
Soybean
LACS family
Abiotic stress
Drought stress
Transcription factorslong-chain acyl-CoA sintasas
Soja
Familia LACS
Estrés abiótico
Estrés por sequía
Factores de transcripción

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 22

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
Las acil-CoA sintasas de cadena larga (LACS) son un factor clave en la formación de acil-CoA después de la hidrólisis de ácidos grasos y desempeñan un papel importante en la resistencia al estrés de las plantas. Esta familia de genes no ha sido investigada en soja. En este estudio, se identificó el genoma completo de la soja ( (L.) Merr.), se seleccionaron los genes de la familia LACS de la soja, y se analizaron la bioinformática, la expresión tisular, el estrés abiótico, el estrés por sequía y la co-expresión de factores de transcripción de la familia de genes para aclarar preliminarmente la función de la familia LACS de la soja. Se seleccionaron un total de 17 genes LACS a partir de datos de secuenciación del genoma de la soja. Se realizó un análisis bioinformático del gen GmLACS desde los aspectos de filogenia, estructura génica, secuencia conservada y elemento homeopático promotor. Los espectros de transcripción de GmLACS en diferentes órganos y estrés abiótico fueron analizados mediante qRT-PCR. Los genes GmLACS, que coexpresan la respuesta significativa al análisis de estrés por sequía y factores de transcripción. Los resultados mostraron que todas las LACS de soja tienen dominios de unión a AMP altamente conservados, y todos los genes de LACS de soja se dividieron en 6 subfamilias. El análisis del transcriptoma indicó los perfiles de expresión de codificación génica bajo estrés alcalino, baja temperatura y sequía. La expresión de GmLACS9/15/17 se reguló significativamente al alza bajo estrés alcalino, baja temperatura y sequía. El análisis de co-expresión mostró una estrecha correlación entre los factores de transcripción y los genes que respondieron significativamente a LACS bajo estrés por sequía. Estos resultados proporcionan una base teórica y empírica para aclarar la función de los genes de la familia LACS y el mecanismo de respuesta al estrés abiótico de la soja.

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