El café, un producto agrícola importante ampliamente consumido, se produce principalmente a partir de dos especies, (café Arábica) y (café Robusta). El Híbrido de Timor (HDT) es una población resultante de un cruce natural entre y . Los derivados de HDT tienen un amplio espectro de resistencia a diferentes razas de (Hv), el agente causal de la roya de la hoja del café. Una base de datos de RNAseq, obtenida de hojas de HDT832/2 inoculadas con Hv (Resistencia del huésped) y (Uv, Resistencia no huésped), mostró la presencia de genes implicados en la respuesta hipersensible y la vía del ácido salicílico. La familia de genes de Reacción Inducida por Hipersensibilidad (HIR), el gen de Susceptibilidad a Enfermedades Mejorada1 (EDS1) y el gen Deficiente en Fitalexinas 4 (PAD4) están involucrados en la resistencia del huésped y no huésped. La expresión relativa calculada por RT-qPCR se utilizó para confirmar y ampliar el análisis del transcriptoma. , , y mostraron la mayor sobreexpresión en respuesta a la inoculación de Hv y Uv, confirmando una tendencia similar en la resistencia del huésped y no huésped en HDT. Las familias de genes HIR y EDS1/PAD4 fueron caracterizadas por primera vez en los tres genomas disponibles. Los genes HIR eran bastante conservados entre especies. Sorprendentemente, los genes EDS1 y PAD4 revelaron diferencias importantes en la estructura génica. La proteína predicha de PAD4 de no incluye ambos dominios conservados de la familia EDS1/PAD4, y la proteína putativa de EDS1 de incluye un dominio de formina inusual en la misma familia de proteínas. La variabilidad mostrada por la familia de genes EDS1/PAD4 puede afectar la respuesta de resistencia a enfermedades de las especies, que pueden ser investigadas para las secuencias génicas que producirán un fenotipo más resistente.