El análisis del transcriptoma hepático revela genes, polimorfismos y moléculas relacionadas con la ternura del cordero
Autores: Listyarini, Kasita; Sumantri, Cece; Rahayu, Sri; Islam, Md. Aminul; Akter, Syeda Hasina; Uddin, Muhammad Jasim; Gunawan, Asep
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
El análisis del transcriptoma hepático revela genes, polimorfismos y moléculas relacionadas con la ternura del cordero
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Zootecnia
Palabras clave
Ternura
Cordero
Genes
Secuenciación
Polimorfismos
Marcadores
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 9
Citaciones: Sin citaciones
La ternura es una característica clave de la calidad de la carne que determina la aceptación pública del consumo de cordero, por lo que la mejora genética hacia corderos con mayor ternura es fundamental para una industria ovina sostenible. Sin embargo, desentrañar la genómica que controla la ternura es el primer paso. Por lo tanto, este estudio tuvo como objetivo identificar las firmas del transcriptoma y los polimorfismos relacionados con la ternura divergente del cordero utilizando secuenciación profunda de ARN. Dado que las moléculas y enzimas que controlan el crecimiento muscular y la ternura se metabolizan y sintetizan en el hígado, se aplicaron tejidos hepáticos de diez ovejas con fenotipos divergentes: cinco muestras de alta ternura y cinco de baja ternura de cordero para la secuenciación profunda. El análisis de secuencias identificó que el número de lecturas oscilaba entre 21.37 y 25.37 millones de bases, con un valor medio de 22.90 millones de bases. En total, se detectaron 328 genes como diferencialmente expresados (DEGs), incluyendo 110 y 218 genes que fueron regulados al alza y a la baja, respectivamente. El análisis de vías mostró que la biosíntesis de hormonas esteroides es la vía dominante detrás de la ternura del cordero. El análisis de expresión génica identificó los principales genes candidatos de alta (como , , , , y ) y baja (como , , , , y ) expresión. El análisis de polimorfismo y asociación reveló que la mutación en , , y genes podría ser marcadores candidatos potenciales para la ternura en ovejas. Los genes y vías identificados en este estudio causan variación en la ternura, por lo que podrían ser marcadores genéticos potenciales para mejorar la calidad de la carne en ovejas. Sin embargo, se necesita una validación adicional para confirmar el efecto de estos marcadores en diferentes poblaciones de ovejas, de modo que puedan ser utilizados en un programa de selección para corderos con alta ternura.
Descripción
La ternura es una característica clave de la calidad de la carne que determina la aceptación pública del consumo de cordero, por lo que la mejora genética hacia corderos con mayor ternura es fundamental para una industria ovina sostenible. Sin embargo, desentrañar la genómica que controla la ternura es el primer paso. Por lo tanto, este estudio tuvo como objetivo identificar las firmas del transcriptoma y los polimorfismos relacionados con la ternura divergente del cordero utilizando secuenciación profunda de ARN. Dado que las moléculas y enzimas que controlan el crecimiento muscular y la ternura se metabolizan y sintetizan en el hígado, se aplicaron tejidos hepáticos de diez ovejas con fenotipos divergentes: cinco muestras de alta ternura y cinco de baja ternura de cordero para la secuenciación profunda. El análisis de secuencias identificó que el número de lecturas oscilaba entre 21.37 y 25.37 millones de bases, con un valor medio de 22.90 millones de bases. En total, se detectaron 328 genes como diferencialmente expresados (DEGs), incluyendo 110 y 218 genes que fueron regulados al alza y a la baja, respectivamente. El análisis de vías mostró que la biosíntesis de hormonas esteroides es la vía dominante detrás de la ternura del cordero. El análisis de expresión génica identificó los principales genes candidatos de alta (como , , , , y ) y baja (como , , , , y ) expresión. El análisis de polimorfismo y asociación reveló que la mutación en , , y genes podría ser marcadores candidatos potenciales para la ternura en ovejas. Los genes y vías identificados en este estudio causan variación en la ternura, por lo que podrían ser marcadores genéticos potenciales para mejorar la calidad de la carne en ovejas. Sin embargo, se necesita una validación adicional para confirmar el efecto de estos marcadores en diferentes poblaciones de ovejas, de modo que puedan ser utilizados en un programa de selección para corderos con alta ternura.