Identificación integral de genes familiares en L. y sus posibles roles en respuesta al estrés abiótico
Autores: Wang, Yongle; Wang, Hongjuan; Lu, Xianyong; Yu, Chun; Jiang, Benli; Zhu, Jiabao; Wang, Yujiao
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
2025
Identificación integral de genes familiares en L. y sus posibles roles en respuesta al estrés abiótico
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Factores de transcripción
Familia de genes
Análisis filogenético
Motivos conservados
QPCR
Tratamientos de estrés
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
Los factores de transcripción de tipo (homeodominio-zíper de leucina) juegan un papel crucial en el crecimiento, desarrollo y respuesta al estrés de las plantas; sin embargo, la familia de genes de L. no ha sido identificada. En este estudio, se identificaron un total de 40 miembros de la familia de genes en el genoma de Coix. Según el análisis filogenético, el gen de Coix se dividió en cuatro subfamilias (I-IV), de las cuales la subfamilia I se puede dividir a su vez en cinco ramas. Además, los miembros de la misma subfamilia suelen compartir estructuras genéticas similares y motivos conservados. El análisis de enriquecimiento de sitios de unión de factores de transcripción mostró que hay muchos motivos para unirse a factores de transcripción como ERF (factor de respuesta al etileno), MYB (homólogo viral del oncogén aviar v-myb) y ARF (factor de respuesta a auxinas) en la región promotora de los genes. Los resultados de qPCR (Reacción en Cadena de la Polimerasa Cuantitativa) y el análisis del perfil de expresión mostraron que los genes mostraron diferentes niveles de expresión bajo diferentes tratamientos de estrés. Entre ellos, se localizó en el núcleo, y su patrón de expresión se reguló significativamente al alza bajo estrés por sal, sequía y altas temperaturas. Además, la expresión ectópica de mejoró el crecimiento de cepas de levadura bajo tratamiento de sequía, sal o altas temperaturas. En resumen, estos resultados sentaron una base para futuras investigaciones sobre la función de resistencia del gen Coix.
Descripción
Los factores de transcripción de tipo (homeodominio-zíper de leucina) juegan un papel crucial en el crecimiento, desarrollo y respuesta al estrés de las plantas; sin embargo, la familia de genes de L. no ha sido identificada. En este estudio, se identificaron un total de 40 miembros de la familia de genes en el genoma de Coix. Según el análisis filogenético, el gen de Coix se dividió en cuatro subfamilias (I-IV), de las cuales la subfamilia I se puede dividir a su vez en cinco ramas. Además, los miembros de la misma subfamilia suelen compartir estructuras genéticas similares y motivos conservados. El análisis de enriquecimiento de sitios de unión de factores de transcripción mostró que hay muchos motivos para unirse a factores de transcripción como ERF (factor de respuesta al etileno), MYB (homólogo viral del oncogén aviar v-myb) y ARF (factor de respuesta a auxinas) en la región promotora de los genes. Los resultados de qPCR (Reacción en Cadena de la Polimerasa Cuantitativa) y el análisis del perfil de expresión mostraron que los genes mostraron diferentes niveles de expresión bajo diferentes tratamientos de estrés. Entre ellos, se localizó en el núcleo, y su patrón de expresión se reguló significativamente al alza bajo estrés por sal, sequía y altas temperaturas. Además, la expresión ectópica de mejoró el crecimiento de cepas de levadura bajo tratamiento de sequía, sal o altas temperaturas. En resumen, estos resultados sentaron una base para futuras investigaciones sobre la función de resistencia del gen Coix.