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El análisis integrado del transcriptoma identificó genes expansinas clave asociados con la pared celular del trigo, el peso del grano y el rendimiento

Autores: Mira, Juan P.; Arenas-M, Anita; Calderini, Daniel F.; Canales, Javier

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2023

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Acceso abierto

Artículo científico
2023

El análisis integrado del transcriptoma identificó genes expansinas clave asociados con la pared celular del trigo, el peso del grano y el rendimiento


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Botánica

Palabras clave

Investigación
Genes de expansión
Desarrollo del grano de trigo
Datos de RNA-seq
Expresión diferencial
Metabolismo de carbohidratos

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 8

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
Esta investigación elucida la expresión dinámica de los genes expansina durante el proceso de desarrollo del grano de trigo (L.) utilizando un meta-análisis integral y validación experimental. Aprovechamos datos de RNA-seq de múltiples bases de datos públicas, aplicando criterios estrictos para la selección, e identificamos 60,852 genes expresados diferencialmente a través de las etapas de desarrollo. De este grupo, se encontró que 28,558 DEGs exhibían una regulación temporal significativa en al menos dos conjuntos de datos diferentes y estaban enriquecidos para procesos integrales al desarrollo del grano, como el metabolismo de carbohidratos y la organización de la pared celular. Notablemente, el 30% de los 241 genes de expansina conocidos mostraron expresión diferencial durante el crecimiento del grano. El análisis de agrupamiento jerárquico y el análisis del nivel de expresión revelaron regulación temporal y contribuciones distintas de las subfamilias de expansina durante las primeras etapas del desarrollo del grano. Un análisis adicional utilizando redes de coexpresión subrayó la importancia de los genes de expansina, revelando su coexpresión sustancial con genes involucrados en la modificación de la pared celular. Finalmente, la validación por qPCR y el análisis morfológico del grano en condiciones de campo indicaron una correlación negativa significativa entre la expresión de ciertos genes de expansina y el tamaño y peso del grano. Este estudio ilumina el papel potencial de los genes de expansina en el desarrollo del grano de trigo y proporciona nuevas vías para mejoras genéticas específicas en el trigo.

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