Análisis Integrativo de Genes Proporciona Perspectivas sobre la Evolución de Familias Específicas de Linaje en Brassicales
Autores: Zou, Zhi; Zhang, Li; Zhao, Yongguo
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Análisis Integrativo de Genes Proporciona Perspectivas sobre la Evolución de Familias Específicas de Linaje en Brassicales
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Oleosinas
Gotas lipídicas
Evolución
Clados
Brassicales
Expresión
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
Los oleosinas (OLEs) son una clase de proteínas estructurales pequeñas pero abundantes que desempeñan roles esenciales en la formación y estabilización de gotas lipídicas (LDs) en semillas de cultivos oleaginosos. A pesar de la propuesta de cinco clados de oleosina (es decir, U, SL, SH, T y M) en angiospermas, su evolución en eudicotiledóneas no ha sido bien establecida. En este estudio, empleamos Brassicales, un orden de plantas con flores de importancia económica que posee el clado T específico de linaje, como un ejemplo para abordar este problema. Se identificaron de tres a diez miembros de diez especies que representan ocho familias de plantas, que incluyen Caricaceae, Moringaceae, Akaniaceae, Capparaceae y Cleomaceae. Los análisis evolutivos y de homología basados en el mejor golpe recíproco asignaron 98 genes en seis clados (es decir, U, SL, SH, M, N y T) y nueve ortogrupos (es decir, U1, U2, SL, SH1, SH2, SH3, M, N y T). El nuevo clado N identificado representa un grupo antiguo que ya ha aparecido en la angiosperma basal, que se expresa de manera constitutiva en el cultivo de frutas de árbol, incluyendo la pulpa y las semillas de la fruta. Además, similar al clado N, el clado M previamente definido no es específico de Lauraceae, sino un grupo antiguo y ampliamente distribuido que se diversificó antes de la radiación de las angiospermas. En comparación con, la expansión específica de linaje de la familia en Brassicales fue en gran parte contribución de duplicaciones recientes de genoma completo (WGD) así como del evento antiguo compartido por todos los eudicotiledóneas centrales. En contraste con la expresión preferencial en flores del clado T, el perfil de transcripción reveló un patrón de expresión predominantemente en semillas/embrión/endospermo de la mayoría de los genes en y. Además, la divergencia de estructura y expresión de pares de parálagos fue frecuentemente observada, y un buen ejemplo es la ganancia específica de linaje de un intrón. Estos hallazgos proporcionan información sobre la evolución de la familia específica de linaje en Brassicales, lo que facilita estudios funcionales adicionales en plantas no modelo como.
Descripción
Los oleosinas (OLEs) son una clase de proteínas estructurales pequeñas pero abundantes que desempeñan roles esenciales en la formación y estabilización de gotas lipídicas (LDs) en semillas de cultivos oleaginosos. A pesar de la propuesta de cinco clados de oleosina (es decir, U, SL, SH, T y M) en angiospermas, su evolución en eudicotiledóneas no ha sido bien establecida. En este estudio, empleamos Brassicales, un orden de plantas con flores de importancia económica que posee el clado T específico de linaje, como un ejemplo para abordar este problema. Se identificaron de tres a diez miembros de diez especies que representan ocho familias de plantas, que incluyen Caricaceae, Moringaceae, Akaniaceae, Capparaceae y Cleomaceae. Los análisis evolutivos y de homología basados en el mejor golpe recíproco asignaron 98 genes en seis clados (es decir, U, SL, SH, M, N y T) y nueve ortogrupos (es decir, U1, U2, SL, SH1, SH2, SH3, M, N y T). El nuevo clado N identificado representa un grupo antiguo que ya ha aparecido en la angiosperma basal, que se expresa de manera constitutiva en el cultivo de frutas de árbol, incluyendo la pulpa y las semillas de la fruta. Además, similar al clado N, el clado M previamente definido no es específico de Lauraceae, sino un grupo antiguo y ampliamente distribuido que se diversificó antes de la radiación de las angiospermas. En comparación con, la expansión específica de linaje de la familia en Brassicales fue en gran parte contribución de duplicaciones recientes de genoma completo (WGD) así como del evento antiguo compartido por todos los eudicotiledóneas centrales. En contraste con la expresión preferencial en flores del clado T, el perfil de transcripción reveló un patrón de expresión predominantemente en semillas/embrión/endospermo de la mayoría de los genes en y. Además, la divergencia de estructura y expresión de pares de parálagos fue frecuentemente observada, y un buen ejemplo es la ganancia específica de linaje de un intrón. Estos hallazgos proporcionan información sobre la evolución de la familia específica de linaje en Brassicales, lo que facilita estudios funcionales adicionales en plantas no modelo como.