Aislamiento y caracterización de los genes involucrados en la vía de síntesis de la berberina en el cohosh azul asiático
Autores: Park, Nam-Il; Roy, Neha Samir; Park, Yeri; Choi, Beom-Soon; Jeon, Mi Jin; Oh, Ji Yeon; Kim, Bo-Yun; Kim, Young-Dong; Kim, Yong-In; Um, Taeyoung; Kwak, Hwan Jong; Kim, Nam-Soo; Kim, Soonok; Choi, Ik-Young
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Aislamiento y caracterización de los genes involucrados en la vía de síntesis de la berberina en el cohosh azul asiático
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Cohosh azul asiático
Berberidáceas
Berberina
Análisis de transcriptoma
Ontología genética
Análisis filogenético
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 7
Citaciones: Sin citaciones
comúnmente llamado cohosh azul asiático, es una hierba perenne de la familia Berberidaceae. Se ha utilizado tradicionalmente en la medicina popular en China. Aislamos berberina de las hojas, tallo, raíces y frutos de, y este es el primer informe sobre berberina en esta especie. Se realizó un análisis del transcriptoma para la caracterización de los genes de biosíntesis de berberina en, en el cual se identificaron todos los genes para la biosíntesis de berberina. De 40,094 transcritos, utilizando análisis de ontología genética (GO), se asignaron funciones a 26,750 transcritos en las categorías de proceso biológico, función molecular y componente celular. En el análisis de genes expresados en diferentes tejidos, los números de genes en las categorías de componente intrínseco de la membrana y actividad transferasa se regulaban al alza en las hojas en comparación con el tallo. Los genes de síntesis de berberina en fueron caracterizados mediante análisis filogenético con genes correspondientes de otras especies productoras de berberina. La coexistencia de genes de diferentes familias de plantas en el subclado de la rama más profunda implica que la diferenciación de los genes de síntesis de berberina ocurrió temprano en la evolución de las plantas productoras de berberina. Además, se detectó un incremento en el número de copias de los genes de síntesis de berberina a nivel de especie.
Descripción
comúnmente llamado cohosh azul asiático, es una hierba perenne de la familia Berberidaceae. Se ha utilizado tradicionalmente en la medicina popular en China. Aislamos berberina de las hojas, tallo, raíces y frutos de, y este es el primer informe sobre berberina en esta especie. Se realizó un análisis del transcriptoma para la caracterización de los genes de biosíntesis de berberina en, en el cual se identificaron todos los genes para la biosíntesis de berberina. De 40,094 transcritos, utilizando análisis de ontología genética (GO), se asignaron funciones a 26,750 transcritos en las categorías de proceso biológico, función molecular y componente celular. En el análisis de genes expresados en diferentes tejidos, los números de genes en las categorías de componente intrínseco de la membrana y actividad transferasa se regulaban al alza en las hojas en comparación con el tallo. Los genes de síntesis de berberina en fueron caracterizados mediante análisis filogenético con genes correspondientes de otras especies productoras de berberina. La coexistencia de genes de diferentes familias de plantas en el subclado de la rama más profunda implica que la diferenciación de los genes de síntesis de berberina ocurrió temprano en la evolución de las plantas productoras de berberina. Además, se detectó un incremento en el número de copias de los genes de síntesis de berberina a nivel de especie.