El análisis de asociación a nivel del genoma descubre genes asociados con la resistencia al patotipo 5 de la pudrición de la cabeza en accesiones de sorgo senegalés
Autores: Ahn, Ezekiel; Prom, Louis K.; Park, Sunchung; Hu, Zhenbin; Magill, Clint W.
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
El análisis de asociación a nivel del genoma descubre genes asociados con la resistencia al patotipo 5 de la pudrición de la cabeza en accesiones de sorgo senegalés
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Patotipo
Hongo transmitido por el suelo
Sorgo
Resistencia
GWAS
SNPs
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
Un nuevo patotipo 5 del hongo del suelo, que causa el tizón de la espiga en el sorgo, fue probado contra 153 accesiones de sorgo senegalés no exploradas. Entre las 153 accesiones de sorgo probadas, 63 (41%) mostraron resistencia completa, sin signos de infección por el hongo. Las 90 accesiones restantes (59%) mostraron diversos grados de susceptibilidad. Se exploraron las respuestas del sorgo para analizar el posible vínculo con rasgos morfológicos de semillas previamente conocidos y nuevos datos fenotípicos de 59 líneas para el peso de la semilla. Un estudio de asociación a nivel genómico (GWAS) examinó 297,876 SNPs e identificó asociaciones altamente significativas (< 1 x 10) con la resistencia al tizón de la espiga en el sorgo. Al mapear estos SNPs significativos al genoma de referencia, este estudio reveló 35 nuevos genes candidatos de defensa potencialmente involucrados en la resistencia a enfermedades.
Descripción
Un nuevo patotipo 5 del hongo del suelo, que causa el tizón de la espiga en el sorgo, fue probado contra 153 accesiones de sorgo senegalés no exploradas. Entre las 153 accesiones de sorgo probadas, 63 (41%) mostraron resistencia completa, sin signos de infección por el hongo. Las 90 accesiones restantes (59%) mostraron diversos grados de susceptibilidad. Se exploraron las respuestas del sorgo para analizar el posible vínculo con rasgos morfológicos de semillas previamente conocidos y nuevos datos fenotípicos de 59 líneas para el peso de la semilla. Un estudio de asociación a nivel genómico (GWAS) examinó 297,876 SNPs e identificó asociaciones altamente significativas (< 1 x 10) con la resistencia al tizón de la espiga en el sorgo. Al mapear estos SNPs significativos al genoma de referencia, este estudio reveló 35 nuevos genes candidatos de defensa potencialmente involucrados en la resistencia a enfermedades.