Identificación y caracterización a nivel genómico de los genes de receptores olfativos en Sillago plateada ()
Autores: Ye, Minghui; Lin, Xinghua; Zhang, Yulei; Huang, Yang; Li, Guangli; Tian, Changxu
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Identificación y caracterización a nivel genómico de los genes de receptores olfativos en Sillago plateada ()
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Zootecnia
Palabras clave
Receptor olfativo
Genes
Peces
Estímulos ambientales
árbol filogenético
Análisis
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 9
Citaciones: Sin citaciones
Los genes de receptores olfativos (OR) son esenciales en el reconocimiento específico de diversos estímulos en los peces. En este estudio, se identificaron un total de 141 genes OR en el sillago plateado, un pez marino sensible a estímulos ambientales, incluyendo 112 genes intactos, 26 genes truncados y tres pseudogenes. Un análisis del árbol filogenético elucidó que los genes OR se clasificaron en seis grupos, de los cuales los grupos beta, y pertenecían al tipo I, y el grupo pertenecía al tipo II. Los genes OR de tipo I contenían casi todos los motivos conservados (62), mientras que los genes OR de tipo II principalmente retuvieron los motivos conservados 7(3), 1, 10, 4 y 2 (39). Los genes OR estaban principalmente distribuidos en LG1, LG9, LG11 y LG12. De todos los genes OR, el 36.23% (50 genes) mostraron una expansión significativa en . El análisis Ka/Ks demostró que 227 sitios estaban bajo selección purificadora, mientras que 12 sitios estaban bajo selección positiva, incluyendo ocho genes en la subfamilia de genes OR2A12. Sesenta y un genes (44.20%) mostraron expresión diferencial bajo estrés hipóxico. Los genes OR identificados exploraron el mecanismo del estrés ambiental y la adaptación ecológica de , y proporcionaron valiosos recursos genómicos para futuras investigaciones sobre la olfacción de los teleósteos.
Descripción
Los genes de receptores olfativos (OR) son esenciales en el reconocimiento específico de diversos estímulos en los peces. En este estudio, se identificaron un total de 141 genes OR en el sillago plateado, un pez marino sensible a estímulos ambientales, incluyendo 112 genes intactos, 26 genes truncados y tres pseudogenes. Un análisis del árbol filogenético elucidó que los genes OR se clasificaron en seis grupos, de los cuales los grupos beta, y pertenecían al tipo I, y el grupo pertenecía al tipo II. Los genes OR de tipo I contenían casi todos los motivos conservados (62), mientras que los genes OR de tipo II principalmente retuvieron los motivos conservados 7(3), 1, 10, 4 y 2 (39). Los genes OR estaban principalmente distribuidos en LG1, LG9, LG11 y LG12. De todos los genes OR, el 36.23% (50 genes) mostraron una expansión significativa en . El análisis Ka/Ks demostró que 227 sitios estaban bajo selección purificadora, mientras que 12 sitios estaban bajo selección positiva, incluyendo ocho genes en la subfamilia de genes OR2A12. Sesenta y un genes (44.20%) mostraron expresión diferencial bajo estrés hipóxico. Los genes OR identificados exploraron el mecanismo del estrés ambiental y la adaptación ecológica de , y proporcionaron valiosos recursos genómicos para futuras investigaciones sobre la olfacción de los teleósteos.