Identificación y caracterización a nivel genómico de la familia de genes en quinoa (Willd.) y sus perfiles de expresión bajo condiciones salinas y alcalinas
Autores: Chen, Yanqiong; Lin, Yingfeng; Zhang, Shubiao; Lin, Zhongyuan; Chen, Songbiao; Wang, Zonghua
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Identificación y caracterización a nivel genómico de la familia de genes en quinoa (Willd.) y sus perfiles de expresión bajo condiciones salinas y alcalinas
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Transportador de potasio
Quinua
Estrés abiótico
Familia de genes
Datos de transcripción
Tolerancia a la sal
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 10
Citaciones: Sin citaciones
La familia de transportadores de K de alta afinidad (HAK), la familia de transportadores de potasio más prominente en las plantas, que involucra el transporte de K, desempeña roles cruciales en las respuestas de las plantas a los estreses abióticos. Sin embargo, la familia de genes aún no ha sido caracterizada en la quinoa (Willd.). Exploramos los HAK en quinoa, identificando 30 miembros en cuatro clústeres filogenéticamente. Se observó una distribución desigual a través de 18 cromosomas. Además, investigamos las relaciones evolutivas de las proteínas, las propiedades fisicoquímicas, los dominios y motivos conservados, la estructura del gen y los elementos reguladores de los miembros de la familia CqHAKs. El análisis de datos de transcripción mostró que tienen patrones de expresión diversos entre diferentes tejidos y en respuesta a estreses abióticos, incluyendo sequía, calor, bajo fósforo y sal. Los cambios de expresión en las raíces fueron más sensibles en respuesta al estrés abiótico que en los ápices de los brotes. El análisis de RT-PCR cuantitativa reveló que bajo condiciones de alta salinidad, y fueron dramáticamente inducidos en las hojas; bajo condiciones alcalinas, y fueron dramáticamente inducidos en las hojas, y, y, y fueron significativamente inducidos en las raíces. Nuestros resultados establecen una base para una investigación más profunda de las funciones de en quinoa. Es el primer estudio en identificar la familia de genes HAK en quinoa, lo que proporciona objetivos potenciales para un estudio funcional adicional y contribuye a mejorar la tolerancia a la sal y la alcalinidad en quinoa.
Descripción
La familia de transportadores de K de alta afinidad (HAK), la familia de transportadores de potasio más prominente en las plantas, que involucra el transporte de K, desempeña roles cruciales en las respuestas de las plantas a los estreses abióticos. Sin embargo, la familia de genes aún no ha sido caracterizada en la quinoa (Willd.). Exploramos los HAK en quinoa, identificando 30 miembros en cuatro clústeres filogenéticamente. Se observó una distribución desigual a través de 18 cromosomas. Además, investigamos las relaciones evolutivas de las proteínas, las propiedades fisicoquímicas, los dominios y motivos conservados, la estructura del gen y los elementos reguladores de los miembros de la familia CqHAKs. El análisis de datos de transcripción mostró que tienen patrones de expresión diversos entre diferentes tejidos y en respuesta a estreses abióticos, incluyendo sequía, calor, bajo fósforo y sal. Los cambios de expresión en las raíces fueron más sensibles en respuesta al estrés abiótico que en los ápices de los brotes. El análisis de RT-PCR cuantitativa reveló que bajo condiciones de alta salinidad, y fueron dramáticamente inducidos en las hojas; bajo condiciones alcalinas, y fueron dramáticamente inducidos en las hojas, y, y, y fueron significativamente inducidos en las raíces. Nuestros resultados establecen una base para una investigación más profunda de las funciones de en quinoa. Es el primer estudio en identificar la familia de genes HAK en quinoa, lo que proporciona objetivos potenciales para un estudio funcional adicional y contribuye a mejorar la tolerancia a la sal y la alcalinidad en quinoa.