Caracterización a Nivel del Genoma de la Familia de Genes de la Quinasa Activada por Mitógenos y Sus Patrones de Expresión en Respuesta a la Sequía y Colletotrichum Gloeosporioides en Nogal ()
Autores: Yang, Kaiyu; Wu, Jianghao; Wang, Xialei; Li, Han; Jia, Peng; Luan, Haoan; Zhang, Xuemei; Guo, Suping; Yang, Minsheng; Dong, Qinglong; Qi, Guohui
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Caracterización a Nivel del Genoma de la Familia de Genes de la Quinasa Activada por Mitógenos y Sus Patrones de Expresión en Respuesta a la Sequía y Colletotrichum Gloeosporioides en Nogal ()
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Quinasas activadas por mitógenos
Nuez
Familia de genes
Respuesta al estrés
RNA-Seq
Historia evolutiva
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 6
Citaciones: Sin citaciones
Las quinasas activadas por mitógenos (MAPKs) son una familia de quinasas de proteínas Ser/Thr (serina/treonina) que desempeñan roles muy importantes en las respuestas de las plantas a estresores bióticos y abióticos. Sin embargo, la familia de genes MAPK en el importante cultivo de nuez (L.) ha sido menos estudiada en comparación con otras especies. Descubrimos 25 miembros en el genoma en este estudio. La familia de genes se separó en cuatro subfamilias basadas en el análisis filogenético, y los miembros del mismo subgrupo tenían motivos y exones/intrones similares. Se detectó una variedad de elementos cis-actuantes, principalmente relacionados con la respuesta a la luz, el crecimiento y desarrollo, la respuesta al estrés y las respuestas hormonales, en los promotores de los genes. El análisis de colinealidad mostró que la selección purificadora fue la principal fuerza impulsora en la evolución de los genes, y las duplicaciones segmentarias y en tándem desempeñaron roles clave en la expansión de la familia de genes. Los resultados de RNA-Seq (secuenciación de ARN) indicaron que muchos de los genes se expresaron en respuesta a diferentes niveles de infección. , , , , , , , , , , , , , y se regulaban al alza a nivel transcripcional en respuesta al tratamiento de estrés por sequía. Los resultados de este estudio ayudarán en investigaciones futuras sobre la historia evolutiva y las funciones biológicas de la familia de genes MAPK en la nuez.
Descripción
Las quinasas activadas por mitógenos (MAPKs) son una familia de quinasas de proteínas Ser/Thr (serina/treonina) que desempeñan roles muy importantes en las respuestas de las plantas a estresores bióticos y abióticos. Sin embargo, la familia de genes MAPK en el importante cultivo de nuez (L.) ha sido menos estudiada en comparación con otras especies. Descubrimos 25 miembros en el genoma en este estudio. La familia de genes se separó en cuatro subfamilias basadas en el análisis filogenético, y los miembros del mismo subgrupo tenían motivos y exones/intrones similares. Se detectó una variedad de elementos cis-actuantes, principalmente relacionados con la respuesta a la luz, el crecimiento y desarrollo, la respuesta al estrés y las respuestas hormonales, en los promotores de los genes. El análisis de colinealidad mostró que la selección purificadora fue la principal fuerza impulsora en la evolución de los genes, y las duplicaciones segmentarias y en tándem desempeñaron roles clave en la expansión de la familia de genes. Los resultados de RNA-Seq (secuenciación de ARN) indicaron que muchos de los genes se expresaron en respuesta a diferentes niveles de infección. , , , , , , , , , , , , , y se regulaban al alza a nivel transcripcional en respuesta al tratamiento de estrés por sequía. Los resultados de este estudio ayudarán en investigaciones futuras sobre la historia evolutiva y las funciones biológicas de la familia de genes MAPK en la nuez.