Identificación y caracterización a nivel genómico de la familia de genes de poligalacturonasa en la veza común ()
Autores: Yang, Xiaobing; Liu, Tianmiao; Yang, Zhongfu; Li, Zhou; Zhao, Xuechun; Chen, Jihui; Gu, Xinyao; He, Jin; Chen, Chao; Dong, Rui
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
2025
Identificación y caracterización a nivel genómico de la familia de genes de poligalacturonasa en la veza común ()
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Agronomía y Ciencia de los Cultivos
Palabras clave
Familia de genes
Pared celular vegetal
Procesos biológicos
Expansión génica
Evolución funcional
Rasgos agronómicos
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 32
Citaciones: Sin citaciones
La familia de genes () juega un papel crucial en el metabolismo de la pared celular de las plantas y participa en varios procesos biológicos, como la maduración de frutos, la dehiscencia de vainas y el crecimiento del tubo polínico. Sin embargo, los miembros de la familia de genes en siguen siendo en gran parte inexplorados. Identificamos y analizamos los miembros de la familia de genes en para investigar su expansión génica, evolución funcional y posibles asociaciones con rasgos agronómicos. Se identificaron un total de 83 genes (), 51 de los cuales conservaban los cuatro dominios característicos de PG (I-IV). Clasificamos los VsPGs en siete subgrupos (A-G) basados en los resultados del análisis filogenético, y el análisis de colinealidad sugirió que la duplicación segmentaria fue el principal impulsor de la expansión de la familia. Los promotores de los VsPG estaban enriquecidos con elementos responsivos al ácido abscísico, bajas temperaturas y estrés por aluminio. Los análisis transcriptómicos y de qPCR revelaron patrones de expresión específicos de tejido y sensibles al estrés de los . Notablemente, y estaban altamente expresados en las suturas ventrales de las variedades dehiscentes de vaina, mientras que y , entre otros, fueron co-expresados bajo frío y estrés por aluminio. Este estudio sienta las bases para una mayor exploración de las funciones biológicas de .
Descripción
La familia de genes () juega un papel crucial en el metabolismo de la pared celular de las plantas y participa en varios procesos biológicos, como la maduración de frutos, la dehiscencia de vainas y el crecimiento del tubo polínico. Sin embargo, los miembros de la familia de genes en siguen siendo en gran parte inexplorados. Identificamos y analizamos los miembros de la familia de genes en para investigar su expansión génica, evolución funcional y posibles asociaciones con rasgos agronómicos. Se identificaron un total de 83 genes (), 51 de los cuales conservaban los cuatro dominios característicos de PG (I-IV). Clasificamos los VsPGs en siete subgrupos (A-G) basados en los resultados del análisis filogenético, y el análisis de colinealidad sugirió que la duplicación segmentaria fue el principal impulsor de la expansión de la familia. Los promotores de los VsPG estaban enriquecidos con elementos responsivos al ácido abscísico, bajas temperaturas y estrés por aluminio. Los análisis transcriptómicos y de qPCR revelaron patrones de expresión específicos de tejido y sensibles al estrés de los . Notablemente, y estaban altamente expresados en las suturas ventrales de las variedades dehiscentes de vaina, mientras que y , entre otros, fueron co-expresados bajo frío y estrés por aluminio. Este estudio sienta las bases para una mayor exploración de las funciones biológicas de .