Investigación a Nivel Genómico de Genes de Peroxidasa de Clase III en Revela Su Responsividad a Estrés Abiótico
Autores: Shah, Obaid Ullah; Khan, Latif Ullah; Basharat, Sana; Zhou, Lingling; Ikram, Muhammad; Peng, Jiantao; Khan, Wasi Ullah; Liu, Pingwu; Waseem, Muhammad
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Investigación a Nivel Genómico de Genes de Peroxidasa de Clase III en Revela Su Responsividad a Estrés Abiótico
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Estrés abiótico
Genes
Peroxidasa
Análisis del patrón de expresión
Datos de RNA-seq
Análisis de RT-qPCR
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 14
Citaciones: Sin citaciones
() es susceptible a múltiples estrés abióticos que pueden afectar el crecimiento y desarrollo de las plantas, reduciendo en última instancia los rendimientos de los cultivos. En el pasado, se han identificado y caracterizado muchos genes que proporcionan tolerancia a los estrés abióticos. Las proteínas peroxidasa (POD), miembros de la familia de enzimas oxidoreductasas, juegan un papel crítico en la protección de las plantas contra los estrés abióticos. Este estudio demostró una investigación exhaustiva de la familia de genes en . Como resultado, se identificaron un total de 109 genes a través de los 19 cromosomas y se clasificaron en cinco subgrupos distintos. Además, se identificaron 44 eventos de duplicación; de estos, dos pares de genes fueron en tándem y 42 fueron segmentales. El análisis de sinonimia reveló que la duplicación segmental fue más prominente que la duplicación en tándem entre los genes. El análisis del patrón de expresión basado en los datos de RNA-seq indicó que los genes se expresaron de manera diferente en varios tejidos; la mayoría de ellos se expresaron en raíces en lugar de en otros tejidos. Para validar estos hallazgos, realizamos un análisis de RT-qPCR en diez genes; estos genes mostraron varios niveles de expresión bajo estrés abióticos. Nuestros hallazgos no solo proporcionan valiosos conocimientos sobre la dinámica evolutiva de la familia de genes, sino que también sirven como base para investigaciones posteriores sobre los roles funcionales de los genes en .
Descripción
() es susceptible a múltiples estrés abióticos que pueden afectar el crecimiento y desarrollo de las plantas, reduciendo en última instancia los rendimientos de los cultivos. En el pasado, se han identificado y caracterizado muchos genes que proporcionan tolerancia a los estrés abióticos. Las proteínas peroxidasa (POD), miembros de la familia de enzimas oxidoreductasas, juegan un papel crítico en la protección de las plantas contra los estrés abióticos. Este estudio demostró una investigación exhaustiva de la familia de genes en . Como resultado, se identificaron un total de 109 genes a través de los 19 cromosomas y se clasificaron en cinco subgrupos distintos. Además, se identificaron 44 eventos de duplicación; de estos, dos pares de genes fueron en tándem y 42 fueron segmentales. El análisis de sinonimia reveló que la duplicación segmental fue más prominente que la duplicación en tándem entre los genes. El análisis del patrón de expresión basado en los datos de RNA-seq indicó que los genes se expresaron de manera diferente en varios tejidos; la mayoría de ellos se expresaron en raíces en lugar de en otros tejidos. Para validar estos hallazgos, realizamos un análisis de RT-qPCR en diez genes; estos genes mostraron varios niveles de expresión bajo estrés abióticos. Nuestros hallazgos no solo proporcionan valiosos conocimientos sobre la dinámica evolutiva de la familia de genes, sino que también sirven como base para investigaciones posteriores sobre los roles funcionales de los genes en .