La familia de genes en el pepino (L.): identificación a nivel genómico y análisis de expresión génica en respuesta a fitohormonas y estrés abiótico
Autores: Zhang, Yongxue; Zhu, Kaili; Shen, Weiyao; Cui, Jiawei; Miao, Chen; Lu, Panling; Wu, Shaofang; Zhu, Cuifang; Jin, Haijun; Zhang, Hongmei; Chang, Liying; Ding, Xiaotao
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
2025
La familia de genes en el pepino (L.): identificación a nivel genómico y análisis de expresión génica en respuesta a fitohormonas y estrés abiótico
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Auxina
Proteína PIN
Familia de genes
Elementos cis-actuantes
Proteínas relacionadas con la auxina
Perfiles de expresión
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 10
Citaciones: Sin citaciones
La proteína transportadora de eflujo de auxina PIN juega un papel crucial en la distribución asimétrica de auxina en la membrana plasmática, influyendo en el crecimiento y desarrollo de los órganos de las plantas. En este estudio, identificamos nueve miembros de la familia de genes en el genoma del pepino, que podrían clasificarse en cinco grupos filogenéticos. Estos genes tienen estructuras diversas pero dominios transmembrana conservados. El análisis de elementos cis-actuantes en los promotores reveló que contienen 48 tipos de elementos cis-actuantes, predominantemente elementos responsivos a la luz y elementos de respuesta a hormonas vegetales. Además, las proteínas PIN pueden interactuar con una variedad de proteínas relacionadas con la auxina (incluyendo factores de respuesta a la auxina, proteínas de unión a la auxina, quinasa de proteínas activada por mitógenos PINOID, etc.) para regular conjuntamente las vías de síntesis y metabolismo de la auxina. Analizamos los perfiles de expresión de genes en 23 tejidos de pepino utilizando la base de datos CuGenDB, y además investigamos los niveles de expresión de genes en hojas y raíces en respuesta a diferentes estrés abióticos y tratamientos hormonales mediante qRT-PCR. Este estudio proporciona una base teórica para aclarar el mecanismo regulador de la familia de genes del pepino durante los procesos de estrés ambiental.
Descripción
La proteína transportadora de eflujo de auxina PIN juega un papel crucial en la distribución asimétrica de auxina en la membrana plasmática, influyendo en el crecimiento y desarrollo de los órganos de las plantas. En este estudio, identificamos nueve miembros de la familia de genes en el genoma del pepino, que podrían clasificarse en cinco grupos filogenéticos. Estos genes tienen estructuras diversas pero dominios transmembrana conservados. El análisis de elementos cis-actuantes en los promotores reveló que contienen 48 tipos de elementos cis-actuantes, predominantemente elementos responsivos a la luz y elementos de respuesta a hormonas vegetales. Además, las proteínas PIN pueden interactuar con una variedad de proteínas relacionadas con la auxina (incluyendo factores de respuesta a la auxina, proteínas de unión a la auxina, quinasa de proteínas activada por mitógenos PINOID, etc.) para regular conjuntamente las vías de síntesis y metabolismo de la auxina. Analizamos los perfiles de expresión de genes en 23 tejidos de pepino utilizando la base de datos CuGenDB, y además investigamos los niveles de expresión de genes en hojas y raíces en respuesta a diferentes estrés abióticos y tratamientos hormonales mediante qRT-PCR. Este estudio proporciona una base teórica para aclarar el mecanismo regulador de la familia de genes del pepino durante los procesos de estrés ambiental.