Identificación a nivel genómico de genes de modificación de histonas y análisis de su expresión durante el proceso de floración y bajo tratamientos con azacitidina y etileno
Autores: Xia, Hui; Zhang, Yingting; Chen, Xiang; Zeng, Xiangling; Cai, Xuan; Li, Zeqing; Chen, Hongguo; Yang, Jie; Zou, Jingjing
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Identificación a nivel genómico de genes de modificación de histonas y análisis de su expresión durante el proceso de floración y bajo tratamientos con azacitidina y etileno
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Acetilación de histonas
Metilación
Familias de genes
Modificación de histonas
árboles ornamentales de horticultura
Osmanthus dulce
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 13
Citaciones: Sin citaciones
La acetilación y metilación de histonas, gobernadas por varias familias de genes de modificación de histonas (HM), son vitales para los procesos biológicos de las plantas. Sin embargo, hay estudios limitados que han explorado en árboles ornamentales, incluyendo el osmanthus dulce. Realizamos una búsqueda a nivel genómico e identificamos 208 genes, que abarcan 81 metiltransferasas de histonas (OfHMTs), 51 desmetilasas de histonas (OfHDMs), 49 acetiltransferasas de histonas (OfHATs) y 27 desacetilasas de histonas (HDACs). Nuestro análisis exhaustivo cubrió las ubicaciones cromosómicas, estructuras de genes, dominios conservados, elementos reguladores, comparaciones filogenéticas, redes de interacción de proteínas y vías de enriquecimiento funcional para estas familias de genes. Además, se revelaron replicaciones en tándem y fragmentos como contribuyentes a la expansión de estas familias, con algunos genes exhibiendo selección positiva. Además, examinamos los perfiles de expresión en varios tejidos y etapas de floración, y bajo tratamientos con 5-azacitidina (Aza) y etileno. La mayoría mostró una mayor expresión en las hojas y se reguló a la baja durante las etapas de apertura de flores y senescencia, incluyendo varios genes; el 75.86% y el 80.77% de los expresados diferencialmente se reguló al alza después de los tratamientos con Aza y etileno, incluyendo algunos genes. Este estudio ofrece un análisis completo de la familia de genes, lo que indica su posible participación en las respuestas al etileno y Aza, y en el proceso de floración. Estos hallazgos proporcionan valiosos conocimientos sobre el papel de estos genes en la floración y las respuestas al estrés.
Descripción
La acetilación y metilación de histonas, gobernadas por varias familias de genes de modificación de histonas (HM), son vitales para los procesos biológicos de las plantas. Sin embargo, hay estudios limitados que han explorado en árboles ornamentales, incluyendo el osmanthus dulce. Realizamos una búsqueda a nivel genómico e identificamos 208 genes, que abarcan 81 metiltransferasas de histonas (OfHMTs), 51 desmetilasas de histonas (OfHDMs), 49 acetiltransferasas de histonas (OfHATs) y 27 desacetilasas de histonas (HDACs). Nuestro análisis exhaustivo cubrió las ubicaciones cromosómicas, estructuras de genes, dominios conservados, elementos reguladores, comparaciones filogenéticas, redes de interacción de proteínas y vías de enriquecimiento funcional para estas familias de genes. Además, se revelaron replicaciones en tándem y fragmentos como contribuyentes a la expansión de estas familias, con algunos genes exhibiendo selección positiva. Además, examinamos los perfiles de expresión en varios tejidos y etapas de floración, y bajo tratamientos con 5-azacitidina (Aza) y etileno. La mayoría mostró una mayor expresión en las hojas y se reguló a la baja durante las etapas de apertura de flores y senescencia, incluyendo varios genes; el 75.86% y el 80.77% de los expresados diferencialmente se reguló al alza después de los tratamientos con Aza y etileno, incluyendo algunos genes. Este estudio ofrece un análisis completo de la familia de genes, lo que indica su posible participación en las respuestas al etileno y Aza, y en el proceso de floración. Estos hallazgos proporcionan valiosos conocimientos sobre el papel de estos genes en la floración y las respuestas al estrés.