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Identificación a nivel genómico de genes de modificación de histonas y análisis de su expresión durante el proceso de floración y bajo tratamientos con azacitidina y etileno

Autores: Xia, Hui; Zhang, Yingting; Chen, Xiang; Zeng, Xiangling; Cai, Xuan; Li, Zeqing; Chen, Hongguo; Yang, Jie; Zou, Jingjing

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2024

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Acceso abierto

Artículo científico
2024

Identificación a nivel genómico de genes de modificación de histonas y análisis de su expresión durante el proceso de floración y bajo tratamientos con azacitidina y etileno


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Botánica

Palabras clave

Acetilación de histonas
Metilación
Familias de genes
Modificación de histonas
árboles ornamentales de horticultura
Osmanthus dulce

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 13

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
La acetilación y metilación de histonas, gobernadas por varias familias de genes de modificación de histonas (HM), son vitales para los procesos biológicos de las plantas. Sin embargo, hay estudios limitados que han explorado en árboles ornamentales, incluyendo el osmanthus dulce. Realizamos una búsqueda a nivel genómico e identificamos 208 genes, que abarcan 81 metiltransferasas de histonas (OfHMTs), 51 desmetilasas de histonas (OfHDMs), 49 acetiltransferasas de histonas (OfHATs) y 27 desacetilasas de histonas (HDACs). Nuestro análisis exhaustivo cubrió las ubicaciones cromosómicas, estructuras de genes, dominios conservados, elementos reguladores, comparaciones filogenéticas, redes de interacción de proteínas y vías de enriquecimiento funcional para estas familias de genes. Además, se revelaron replicaciones en tándem y fragmentos como contribuyentes a la expansión de estas familias, con algunos genes exhibiendo selección positiva. Además, examinamos los perfiles de expresión en varios tejidos y etapas de floración, y bajo tratamientos con 5-azacitidina (Aza) y etileno. La mayoría mostró una mayor expresión en las hojas y se reguló a la baja durante las etapas de apertura de flores y senescencia, incluyendo varios genes; el 75.86% y el 80.77% de los expresados diferencialmente se reguló al alza después de los tratamientos con Aza y etileno, incluyendo algunos genes. Este estudio ofrece un análisis completo de la familia de genes, lo que indica su posible participación en las respuestas al etileno y Aza, y en el proceso de floración. Estos hallazgos proporcionan valiosos conocimientos sobre el papel de estos genes en la floración y las respuestas al estrés.

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