Caracterización de la familia de genes de la isocitrato deshidrogenasa y su respuesta al estrés por sequía en maíz
Autores: Wei, Ningning; Zhang, Ziran; Yang, Haoxiang; Hu, Die; Wu, Ying; Xue, Jiquan; Guo, Dongwei; Xu, Shutu
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Caracterización de la familia de genes de la isocitrato deshidrogenasa y su respuesta al estrés por sequía en maíz
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Deshidrogenasa isocitrato
Ciclo del ácido tricarboxílico
Síntesis de glutamina
Genes de maíz
Estrés abiótico
Tolerancia a la sequía
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
La isocitrato deshidrogenasa (IDH) es una enzima clave limitante de la velocidad en el ciclo del ácido tricarboxílico y actúa en la síntesis de glutamina. IDH también participa en el crecimiento y desarrollo de las plantas y en la respuesta a estrés abiótico. Identificamos 11 genes de maíz y clasificamos estos genes en grupos basados en sus diferentes coenzimas (NAD o NADP). El grupo se dividió además en dos subgrupos de acuerdo con sus subunidades catalíticas y no catalíticas. Los grupos diferían significativamente en propiedades fisicoquímicas, estructura genética, motivos conservados y estructura terciaria de proteínas. El análisis de predicción de promotores reveló que los promotores de estos contienen elementos cis-actuantes asociados con la respuesta a la luz, ácido abscísico, fitohormonas y estrés abiótico. Se predice que interactúa con proteínas involucradas en el desarrollo y resistencia al estrés. El análisis de expresión de datos públicos reveló que la mayoría se expresa específicamente en anteras. Diferentes tipos respondieron a estrés abiótico con diferentes patrones de expresión, pero todos mostraron respuestas a estrés abiótico en cierta medida. Además, el análisis de la secuencia pública de datos de transcripción en un panel de asociación sugirió que la variación natural en estará asociada con la tolerancia a la sequía en maíz. Estos resultados sugieren que responden de manera diferente y/o redundante a estrés abiótico durante el crecimiento y desarrollo de las plantas, y este análisis proporciona una base para entender cómo responden al estrés por sequía en maíz.
Descripción
La isocitrato deshidrogenasa (IDH) es una enzima clave limitante de la velocidad en el ciclo del ácido tricarboxílico y actúa en la síntesis de glutamina. IDH también participa en el crecimiento y desarrollo de las plantas y en la respuesta a estrés abiótico. Identificamos 11 genes de maíz y clasificamos estos genes en grupos basados en sus diferentes coenzimas (NAD o NADP). El grupo se dividió además en dos subgrupos de acuerdo con sus subunidades catalíticas y no catalíticas. Los grupos diferían significativamente en propiedades fisicoquímicas, estructura genética, motivos conservados y estructura terciaria de proteínas. El análisis de predicción de promotores reveló que los promotores de estos contienen elementos cis-actuantes asociados con la respuesta a la luz, ácido abscísico, fitohormonas y estrés abiótico. Se predice que interactúa con proteínas involucradas en el desarrollo y resistencia al estrés. El análisis de expresión de datos públicos reveló que la mayoría se expresa específicamente en anteras. Diferentes tipos respondieron a estrés abiótico con diferentes patrones de expresión, pero todos mostraron respuestas a estrés abiótico en cierta medida. Además, el análisis de la secuencia pública de datos de transcripción en un panel de asociación sugirió que la variación natural en estará asociada con la tolerancia a la sequía en maíz. Estos resultados sugieren que responden de manera diferente y/o redundante a estrés abiótico durante el crecimiento y desarrollo de las plantas, y este análisis proporciona una base para entender cómo responden al estrés por sequía en maíz.