En comparación con las ovejas indígenas chinas, las ovejas occidentales tienen una tasa de crecimiento rápida, un físico más grande y un mayor rendimiento de carne. Estas excelentes ovejas occidentales fueron introducidas en China para el cruce con el fin de acelerar la mejora del rendimiento de producción y la calidad de la carne de cordero en las razas locales. Aquí, investigamos la estructura genética poblacional y las firmas de selección a nivel genómico entre las ovejas indígenas chinas y las ovejas introducidas basándonos en datos de resecuenciación del genoma completo. Los resultados del PCA, el árbol N-J y ADMIXTURE mostraron una diferencia genética significativa entre las ovejas indígenas chinas y las ovejas introducidas. La diversidad nucleotídica y los resultados de la decadencia del desequilibrio de ligamiento indicaron que la diversidad genómica de las razas introducidas era menor. Luego, se utilizaron los métodos de razón F & , XP-EHH y el compuesto decorrelacionado de múltiples señales (DCMS) para detectar las señales de selección. Los resultados mostraron que identificamos genes candidatos importantes relacionados con la tasa de crecimiento y el tamaño corporal en las razas introducidas. Los genes seleccionados con firmas de selección más fuertes están asociados con la tasa de crecimiento, el desarrollo embrionario, el tamaño corporal, el desarrollo muscular y el metabolismo de grasas, el color de la lana y el desarrollo del pelo. Por lo tanto, estos genes tienen el potencial de servir como genes candidatos para mejorar los rasgos de crecimiento de las ovejas indígenas chinas. También identificamos genes candidatos relacionados con el rasgo de longitud de cola en las razas chinas de cola larga. Entre estos genes, uno es el principal gen candidato para el fenotipo de longitud de cola de oveja. Otros están relacionados con el desarrollo embrionario y la angiogénesis, por lo que estos genes pueden ser genes candidatos para los rasgos de tipo de cola de oveja. Este estudio servirá como base para una mejora genética adicional de las ovejas indígenas chinas y como referencia para estudios relacionados con el crecimiento y desarrollo de las ovejas.