Este trabajo tuvo como objetivo evaluar la variabilidad de los genes de caseína en una población de 153 machos y 825 hembras lactantes de la raza Sarda, y realizar un análisis de asociación entre sitios polimórficos y rasgos de rendimiento y composición de la leche. Para genotipar los genes de caseína, elegimos un panel de SNP que incluye 44 SNPs que mapean a los cuatro genes de caseína. El genotipado (realizado mediante el ensayo de genotipado KASP(tm), basado en PCR específica de alelos competitivos) reveló la alta variabilidad de la cabra Sarda, y el análisis de haplotipos reveló desequilibrio de ligamiento (LD) entre los genes, además de dos bloques de LD dentro de los genes, en machos y hembras. El análisis de asociación reveló que la variabilidad en los cuatro genes de caseína estaba asociada con el contenido de proteínas de la leche, sólidos totales y energía de la leche. Los tres genes de caseína sensibles al calcio estaban asociados con el contenido de lípidos y mostraron un patrón único, con variantes intrónicas asociadas con el rendimiento de la leche, además de pH de la leche, NaCl y SCS (Puntuación de Células Somáticas). Esta información podría resultar útil en esquemas de selección y en futuras investigaciones que busquen comprender mejor la biología de la lactancia y la relación directa entre genotipo y fenotipo.