El análisis del transcriptoma reveló genes clave relacionados con la resistencia al tipburn en el repollo chino (L. ssp.)
Autores: Bi, Yaning; Zhang, Wenjing; Yuan, Yuxiang; Feng, Jianqi; Wang, Peiyun; Ding, Cong; Zhao, Yanyan; Li, Lin; Su, Henan; Tian, Baoming; Wei, Fang; Wei, Xiaochun; Zhang, Xiaowei
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
2025
El análisis del transcriptoma reveló genes clave relacionados con la resistencia al tipburn en el repollo chino (L. ssp.)
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Enfermedad fisiológica
Col china
Deficiencia de calcio
Análisis del transcriptoma
Módulos génicos
Resistencia al tipburn
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 7
Citaciones: Sin citaciones
El tipburn es una enfermedad fisiológica en el repollo chino. En los últimos años, esta enfermedad se ha vuelto cada vez más grave, afectando la calidad y los beneficios económicos del repollo chino. Sin embargo, se sabe poco sobre el mecanismo molecular por el cual la deficiencia de calcio induce el tipburn. Por lo tanto, realizamos un análisis de transcriptoma en Y578-2 (acceso resistente al tipburn) y Y920-2 (acceso susceptible al tipburn) para identificar los genes involucrados en el mecanismo de defensa contra el tipburn en el repollo chino. En este estudio, la observación fenotípica mostró que Y920-2 comenzó a mostrar síntomas en el décimo día del tratamiento de deficiencia de calcio. A través del análisis de red de coexpresión génica ponderada (WGCNA), se identificaron tres módulos génicos que estaban altamente relacionados con la resistencia al tipburn. El análisis de la regulación de la expresión génica en los tres módulos reveló 13 genes clave relacionados con la resistencia al tipburn, que estaban involucrados en la pared celular, la fotosíntesis, factores de transcripción, hormonas y la respuesta al estrés, lo que indica que estos factores juegan un papel importante en la respuesta al tipburn del repollo chino. Estos datos de transcriptoma y los resultados del análisis proporcionan una base para el estudio del mecanismo molecular del tipburn inducido por deficiencia de calcio en el repollo chino.
Descripción
El tipburn es una enfermedad fisiológica en el repollo chino. En los últimos años, esta enfermedad se ha vuelto cada vez más grave, afectando la calidad y los beneficios económicos del repollo chino. Sin embargo, se sabe poco sobre el mecanismo molecular por el cual la deficiencia de calcio induce el tipburn. Por lo tanto, realizamos un análisis de transcriptoma en Y578-2 (acceso resistente al tipburn) y Y920-2 (acceso susceptible al tipburn) para identificar los genes involucrados en el mecanismo de defensa contra el tipburn en el repollo chino. En este estudio, la observación fenotípica mostró que Y920-2 comenzó a mostrar síntomas en el décimo día del tratamiento de deficiencia de calcio. A través del análisis de red de coexpresión génica ponderada (WGCNA), se identificaron tres módulos génicos que estaban altamente relacionados con la resistencia al tipburn. El análisis de la regulación de la expresión génica en los tres módulos reveló 13 genes clave relacionados con la resistencia al tipburn, que estaban involucrados en la pared celular, la fotosíntesis, factores de transcripción, hormonas y la respuesta al estrés, lo que indica que estos factores juegan un papel importante en la respuesta al tipburn del repollo chino. Estos datos de transcriptoma y los resultados del análisis proporcionan una base para el estudio del mecanismo molecular del tipburn inducido por deficiencia de calcio en el repollo chino.