Las pectin metilesterasas (PMEs) y sus inhibidores (PMEIs) son enzimas fundamentales en las modificaciones de metilación de la pectina, desempeñando roles cruciales en la morfogénesis de las plantas, la adhesión celular y el mantenimiento de la integridad de la pared celular. Sin embargo, ha habido estudios limitados que exploran las funciones de las familias de genes en el proceso de curación de plántulas de pepino injertadas y sus respuestas a condiciones de estrés. En este estudio, identificamos 52 miembros de la familia y 33 miembros de la familia, así como 86 miembros de la familia y 36 miembros de la familia. Se realizaron análisis exhaustivos de las familias de genes en pepino y calabaza utilizando técnicas bioinformáticas. Además, las familias de genes en pepino y calabaza mostraron modos de expresión distintos en diferentes órganos vegetativos de plántulas injertadas homólogas/heterólogas y bajo estrés por frío. Notablemente, las plántulas injertadas de pepino/calabaza mostraron respuestas en las raíces y hojas que involucraban genes tipo y tipo I, facilitando su adaptación al estrés por frío. Además, una investigación sobre la capacidad de respuesta de las plántulas injertadas de pepino/calabaza durante la fase de curación a diferentes modos de intensidad de luz reveló que la implementación de un modo de alta intensidad de luz resultó en una regulación al alza de los niveles de expresión de la mayoría de los genes de la familia, particularmente aquellos que pertenecen a la familia, durante las etapas críticas de formación de la capa de aislamiento y del callo. Basado en estos hallazgos, se seleccionaron seis miembros clave de la familia que responden a diferentes modos de intensidad de luz durante la curación del injerto. A través de la predicción de sitios de unión de factores de transcripción y un análisis de la respuesta a diferentes modos de intensidad de luz durante la curación del injerto, se identificaron cuatro factores de transcripción con posibles relaciones regulatorias con estos seis genes clave. Esto sugiere que las plántulas injertadas de pepino/calabaza pueden regular genes clave a través de factores en respuesta a diferentes modos de intensidad de luz durante el proceso de curación, influyendo así en el progreso de la curación del injerto.