La identificación a nivel genómico, expansión, evolución y análisis de expresión revela genes importantes para el desarrollo de la pared celular secundaria en bambú Moso (Phyllostachys edulis)
Autores: Que, Feng; Zhu, Yaqi; Liu, Qingnan; Wei, Qiang; Ramakrishnan, Muthusamy
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
La identificación a nivel genómico, expansión, evolución y análisis de expresión revela genes importantes para el desarrollo de la pared celular secundaria en bambú Moso (Phyllostachys edulis)
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Agronomía y Ciencia de los Cultivos
Palabras clave
Subfamilia b de la casete de unión a ATP
Bambú moso
Expansión de la familia génica
Pared celular secundaria
Análisis de co-expresión génica
Desarrollo de la pared celular secundaria
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 20
Citaciones: Sin citaciones
La subfamilia B de la casete de unión a ATP (ABCB) es una importante familia de transportadores, y muchos miembros son conocidos por su función de transporte de auxinas. Sin embargo, hay pocos informes sobre la función de los genes durante el desarrollo del bambú Moso. En este estudio, identificamos y caracterizamos 37 genes en el bambú Moso y los clasificamos en cinco subgrupos. Además, observamos eventos de expansión y pérdida de genes en la evolución de la familia de genes. Se encontró que la expansión de la familia se atribuyó principalmente a la duplicación de genomas completos y a modelos de duplicación transpuesta de ADN. El análisis de co-expresión génica y la PCR cuantitativa en tiempo real revelaron que varios genes pueden estar involucrados en el desarrollo de la pared celular secundaria (SCW) durante el rápido crecimiento del bambú Moso. Al examinar su expresión en diferentes partes del entrenudo del bambú donde las paredes celulares mostraban diferentes etapas de desarrollo, se caracterizaron aún más los roles de ocho candidatos en el desarrollo de la SCW. De los ocho genes, , , , y pueden estar involucrados en la biogénesis de la SCW en el bambú Moso. Este estudio proporciona la base para descubrir el papel potencial de los genes en el desarrollo de la pared celular del bambú Moso; se necesitan más estudios para dilucidar cómo estas funciones en el desarrollo de la SCW al regular el transporte polar de auxinas.
Descripción
La subfamilia B de la casete de unión a ATP (ABCB) es una importante familia de transportadores, y muchos miembros son conocidos por su función de transporte de auxinas. Sin embargo, hay pocos informes sobre la función de los genes durante el desarrollo del bambú Moso. En este estudio, identificamos y caracterizamos 37 genes en el bambú Moso y los clasificamos en cinco subgrupos. Además, observamos eventos de expansión y pérdida de genes en la evolución de la familia de genes. Se encontró que la expansión de la familia se atribuyó principalmente a la duplicación de genomas completos y a modelos de duplicación transpuesta de ADN. El análisis de co-expresión génica y la PCR cuantitativa en tiempo real revelaron que varios genes pueden estar involucrados en el desarrollo de la pared celular secundaria (SCW) durante el rápido crecimiento del bambú Moso. Al examinar su expresión en diferentes partes del entrenudo del bambú donde las paredes celulares mostraban diferentes etapas de desarrollo, se caracterizaron aún más los roles de ocho candidatos en el desarrollo de la SCW. De los ocho genes, , , , y pueden estar involucrados en la biogénesis de la SCW en el bambú Moso. Este estudio proporciona la base para descubrir el papel potencial de los genes en el desarrollo de la pared celular del bambú Moso; se necesitan más estudios para dilucidar cómo estas funciones en el desarrollo de la SCW al regular el transporte polar de auxinas.