Secuenciación del transcriptoma de hojas revela genes clave involucrados en la biosíntesis de flavonoides
Autores: Guo, Peng; Huang, Ziqi; Li, Xinke; Zhao, Wei; Wang, Yihan
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Secuenciación del transcriptoma de hojas revela genes clave involucrados en la biosíntesis de flavonoides
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Flavonoides
Antioxidante
Antibacteriano
Antiinflamatorio
Recursos de transcriptoma
Expresión génica
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 7
Citaciones: Sin citaciones
es rico en flavonoides, que tienen actividades antioxidantes, antibacterianas y antiinflamatorias significativas, así como ciertas actividades farmacológicas. Sin embargo, la escasez de recursos de transcriptoma ha impedido un estudio más profundo sobre el proceso de su producción y acumulación. En este estudio, se utilizó RNA-seq para evaluar la expresión génica de las hojas en tres fases de desarrollo distintas (T1: hojas jóvenes, T3: hojas inmaduras, T4: hojas maduras). Obtuvimos 2447 DEGs regulados al alza y 2960 regulados a la baja, 4657 DEGs regulados al alza y 4804 regulados a la baja, y 805 DEGs regulados al alza y 484 regulados a la baja de T1 vs. T3, T1 vs. T4 y T3 vs. T4, respectivamente. Investigaciones adicionales encontraron que las siguientes variables contribuyeron a la formación de flavonoides en las hojas: se han descubierto varios genes de enzimas importantes involucrados en las vías de producción de flavonoides. Los resultados demostraron que la tendencia dinámica cambiante de los contenidos de flavonoides está relacionada con el patrón de expresión de la gran mayoría de los genes esenciales en la vía biosintética. Los genes asociados al metabolismo de energía y glucosa, al metabolismo de polisacáridos, a la pared celular y al citoesqueleto, a la transducción de señales, y al metabolismo de proteínas y aminoácidos pueden afectar el crecimiento y desarrollo de las hojas, y eventualmente su contenido de flavonoides. Los resultados de este estudio ofrecen una sólida plataforma para futuras investigaciones sobre las vías metabólicas.
Descripción
es rico en flavonoides, que tienen actividades antioxidantes, antibacterianas y antiinflamatorias significativas, así como ciertas actividades farmacológicas. Sin embargo, la escasez de recursos de transcriptoma ha impedido un estudio más profundo sobre el proceso de su producción y acumulación. En este estudio, se utilizó RNA-seq para evaluar la expresión génica de las hojas en tres fases de desarrollo distintas (T1: hojas jóvenes, T3: hojas inmaduras, T4: hojas maduras). Obtuvimos 2447 DEGs regulados al alza y 2960 regulados a la baja, 4657 DEGs regulados al alza y 4804 regulados a la baja, y 805 DEGs regulados al alza y 484 regulados a la baja de T1 vs. T3, T1 vs. T4 y T3 vs. T4, respectivamente. Investigaciones adicionales encontraron que las siguientes variables contribuyeron a la formación de flavonoides en las hojas: se han descubierto varios genes de enzimas importantes involucrados en las vías de producción de flavonoides. Los resultados demostraron que la tendencia dinámica cambiante de los contenidos de flavonoides está relacionada con el patrón de expresión de la gran mayoría de los genes esenciales en la vía biosintética. Los genes asociados al metabolismo de energía y glucosa, al metabolismo de polisacáridos, a la pared celular y al citoesqueleto, a la transducción de señales, y al metabolismo de proteínas y aminoácidos pueden afectar el crecimiento y desarrollo de las hojas, y eventualmente su contenido de flavonoides. Los resultados de este estudio ofrecen una sólida plataforma para futuras investigaciones sobre las vías metabólicas.