La necrosis letal del maíz (MLN) es una amenaza significativa para la seguridad alimentaria en el África subsahariana (SSA), con líneas inbred comerciales limitadas que muestran tolerancia. Este estudio analizó los transcriptomas de cuatro líneas inbred de maíz utilizadas comercialmente y una línea inbred no adaptada, todas con diferentes niveles de respuesta al MLN. El RNA-Seq reveló genes expresados diferencialmente en respuesta a la infección por el virus del moteado clorótico del maíz (MCMV) y el virus del mosaico de la caña de azúcar (SCMV), los agentes causantes del MLN. Los hallazgos clave incluyeron la identificación de componentes del sistema inmunológico innato de la planta, como genes R regulados diferencialmente (principalmente LRRs), y la activación/desactivación de vías de resistencia a virus, incluyendo la interferencia de ARN (RNAi) a través de (AGO), y el sistema ubiquitina-proteasoma (UPS) a través de y . También se expresaron diferencialmente genes asociados con la señalización redox, factores de transcripción y modificación celular. Además, la expresión de factores de iniciación y elongación de la traducción, y , se correlacionó con la presencia de virus del MLN. Estos hallazgos proporcionan valiosos conocimientos sobre los mecanismos moleculares de resistencia al MLN y destacan posibles candidatos a genes para la ingeniería o selección de germoplasma de maíz resistente al MLN para el SSA.