Identificación a Nivel Genómico y Análisis de Expresión Revelan Factores de Transcripción bZIP Mediados por Hormonas que Funcionan Durante la Temprana Embriogénesis Somática en
Autores: Zhai, Tingkai; Lan, Shuoxian; Xv, Luzhen; Zhang, Xueying; Ma, Xiangwei; Li, Zhuoyun; Gao, Jie; Chen, Yukun; Lai, Zhongxiong; Lin, Yuling
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Identificación a Nivel Genómico y Análisis de Expresión Revelan Factores de Transcripción bZIP Mediados por Hormonas que Funcionan Durante la Temprana Embriogénesis Somática en
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Factores de transcripción
Crecimiento de plantas
Embriogénesis somática
Vías regulatorias hormonales
Familias de genes
Accesibilidad de la cromatina
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
Los factores de transcripción de leucina básica (bZIP) son un grupo de familias de genes altamente conservadas que desempeñan roles importantes en el crecimiento de las plantas y la resistencia al estrés adverso. Sin embargo, los estudios sobre las vías regulatorias hormonales y el análisis funcional durante la embriogénesis somática (ES) aún no están disponibles. En este estudio, se identificaron sistemáticamente un total de 51 miembros de la familia bZIP en el genoma completo del longan, se realizó un análisis bioinformático integral de los miembros de la familia del longan, y se analizaron la localización subcelular y los patrones de perfiles después de la transformación transitoria. El análisis combinado de RNA-seq, ATAC-seq y ChIP-seq mostró que cuatro miembros tienen picos de unión H3K4me1 diferentes en la ES temprana y se expresan diferencialmente con una mayor accesibilidad de la cromatina. El análisis comparativo del transcriptoma de la expresión de bZIPs en la ES temprana, diferentes tejidos y bajo tratamiento con 2,4-D reveló que la familia podría estar involucrada en el crecimiento y desarrollo durante la ES temprana del longan. Los resultados de qRT-PCR implicaron que la familia estaba sujeta a múltiples respuestas hormonales y mostró diferentes grados de expresión regulada al alza bajo tratamientos con ácido indol-3-acético (IAA), ácido abscísico (ABA) y metil jasmonato (MeJA), lo que indicó que desempeñaron un papel importante en las vías de síntesis hormonal asociadas con la ES temprana del longan. La localización subcelular mostró que DlbZIP60 se localizó en el núcleo, y los contenidos de IAA, MeJA y ABA endógenos se regularon al alza en líneas celulares sobreexpresadas transitoriamente. Estos resultados sugieren que pueden mediar las vías hormonales que funcionan en el desarrollo durante la ES temprana en longan.
Descripción
Los factores de transcripción de leucina básica (bZIP) son un grupo de familias de genes altamente conservadas que desempeñan roles importantes en el crecimiento de las plantas y la resistencia al estrés adverso. Sin embargo, los estudios sobre las vías regulatorias hormonales y el análisis funcional durante la embriogénesis somática (ES) aún no están disponibles. En este estudio, se identificaron sistemáticamente un total de 51 miembros de la familia bZIP en el genoma completo del longan, se realizó un análisis bioinformático integral de los miembros de la familia del longan, y se analizaron la localización subcelular y los patrones de perfiles después de la transformación transitoria. El análisis combinado de RNA-seq, ATAC-seq y ChIP-seq mostró que cuatro miembros tienen picos de unión H3K4me1 diferentes en la ES temprana y se expresan diferencialmente con una mayor accesibilidad de la cromatina. El análisis comparativo del transcriptoma de la expresión de bZIPs en la ES temprana, diferentes tejidos y bajo tratamiento con 2,4-D reveló que la familia podría estar involucrada en el crecimiento y desarrollo durante la ES temprana del longan. Los resultados de qRT-PCR implicaron que la familia estaba sujeta a múltiples respuestas hormonales y mostró diferentes grados de expresión regulada al alza bajo tratamientos con ácido indol-3-acético (IAA), ácido abscísico (ABA) y metil jasmonato (MeJA), lo que indicó que desempeñaron un papel importante en las vías de síntesis hormonal asociadas con la ES temprana del longan. La localización subcelular mostró que DlbZIP60 se localizó en el núcleo, y los contenidos de IAA, MeJA y ABA endógenos se regularon al alza en líneas celulares sobreexpresadas transitoriamente. Estos resultados sugieren que pueden mediar las vías hormonales que funcionan en el desarrollo durante la ES temprana en longan.