Identificación a Nivel del Genoma y Análisis de Expresión de la Familia de Genes en bajo Estrés Salino
Autores: Sun, Daojin; Xu, Jingya; Wang, Haoran; Guo, Hailin; Chen, Yu; Zhang, Ling; Li, Jianjian; Hao, Dongli; Yao, Xiang; Li, Xiaohui
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Identificación a Nivel del Genoma y Análisis de Expresión de la Familia de Genes en bajo Estrés Salino
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Familia de proteínas ub-box
Crecimiento de plantas
Respuestas al estrés
Identificación a nivel genómico
Estructuras génicas
Estrés salino
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 11
Citaciones: Sin citaciones
La familia de proteínas U-box de ligasas de ubiquitina es importante en los procesos biológicos del crecimiento, desarrollo y respuestas a estrés biótico y abiótico en las plantas. Las plantas del género se reconocen como excelentes especies de césped de temporada cálida con tolerancia a la sequía, al desgaste y a la sal. En este estudio, realizamos la identificación a nivel genómico de genes en función de la búsqueda del dominio U-box. En total, se identificaron 71 genes y se construyó un árbol filogenético de AtPUBs, OsPUBs y ZjPUBs, agrupados en cinco grupos. Se analizaron las estructuras genéticas, características, elementos - y la red de predicción de interacción de proteínas. Principalmente, se distribuyeron elementos ABRE, ERE, MYB y MYC en las regiones promotoras de . Se predijo que interactuaban con PDR1 y EXO70B1, relacionados con la vía de señalización del ácido abscísico. Para comprender mejor los roles de bajo estrés salino, se detectaron los niveles de expresión de 18 bajo estrés salino utilizando datos de transcriptoma y análisis de qRT-PCR, revelando que 16 estaban regulados al alza en las raíces bajo tratamiento salino. Esto indica que podría participar en la respuesta al estrés salino. Esta investigación proporciona información sobre la familia de genes y puede apoyar la mejora genética en la cría molecular de variedades de zoysiagrass tolerantes a la sal.
Descripción
La familia de proteínas U-box de ligasas de ubiquitina es importante en los procesos biológicos del crecimiento, desarrollo y respuestas a estrés biótico y abiótico en las plantas. Las plantas del género se reconocen como excelentes especies de césped de temporada cálida con tolerancia a la sequía, al desgaste y a la sal. En este estudio, realizamos la identificación a nivel genómico de genes en función de la búsqueda del dominio U-box. En total, se identificaron 71 genes y se construyó un árbol filogenético de AtPUBs, OsPUBs y ZjPUBs, agrupados en cinco grupos. Se analizaron las estructuras genéticas, características, elementos - y la red de predicción de interacción de proteínas. Principalmente, se distribuyeron elementos ABRE, ERE, MYB y MYC en las regiones promotoras de . Se predijo que interactuaban con PDR1 y EXO70B1, relacionados con la vía de señalización del ácido abscísico. Para comprender mejor los roles de bajo estrés salino, se detectaron los niveles de expresión de 18 bajo estrés salino utilizando datos de transcriptoma y análisis de qRT-PCR, revelando que 16 estaban regulados al alza en las raíces bajo tratamiento salino. Esto indica que podría participar en la respuesta al estrés salino. Esta investigación proporciona información sobre la familia de genes y puede apoyar la mejora genética en la cría molecular de variedades de zoysiagrass tolerantes a la sal.