El síndrome de Mayer-Rokitansky-Küster-Hauser (MRKH) es una enfermedad rara y compleja definida por la aplasia congénita de la vagina y el útero en mujeres 46,XX, a menudo asociada con anomalías renales y del tracto urinario. La etiopatogenia del síndrome MRKH sigue siendo en gran medida desconocida. En este estudio, investigamos el papel de genes candidatos seleccionados en la etiopatogenia del síndrome MRKH, con un enfoque en PRKX, que codifica para la proteína quinasa X. A través de análisis de RT-qPCR realizados en muestras de hendidura vaginal de pacientes y análisis de componentes principales (PCA), destacamos un patrón de expresión relacionado con el fenotipo de PRKX, PRKX y PRKX en pacientes con MRKH. Al utilizar un enfoque in vitro, demostramos que la sobreexpresión ectópica de PRKX en un modelo celular de queratinocitos vaginales promueve la motilidad celular a través de la activación de la transición epitelial a mesenquimal (EMT), un proceso fundamental en la morfogénesis del tracto urogenital. Además, nuestros hallazgos mostraron que la regulación al alza de PRKX en queratinocitos vaginales puede afectar los niveles de transcripción de genes implicados en el desarrollo del tracto urinario y genital. Nuestro estudio identificó la disfunción de la expresión de PRKX como una posible causa molecular del síndrome MRKH. Además, proponemos el papel específico de PRKX en la biología de los queratinocitos vaginales como uno de los posibles mecanismos subyacentes a esta compleja enfermedad.