logo móvil
Contáctanos

Identificación a Nivel Genómico y Análisis de Expresión de la Familia de Genes de Aldehído Deshidrogenasa (ALDH) en Melón en Respuesta a Estrés Abiótico y Biótico

Autores: Yang, Dekun; Chen, Hongli; Zhang, Yu; Wang, Yan; Zhai, Yongqi; Xu, Gang; Ding, Qiangqiang; Wang, Mingxia; Zhang, Qi-an; Lu, Xiaomin; Yan, Congsheng

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2024

Descargar PDF

Acceso abierto

Artículo científico
2024

Identificación a Nivel Genómico y Análisis de Expresión de la Familia de Genes de Aldehído Deshidrogenasa (ALDH) en Melón en Respuesta a Estrés Abiótico y Biótico


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Botánica

Palabras clave

Integración
Información genómica
Datos de secuenciación del transcriptoma
Métodos bioinformáticos
Familia de genes ALDH
Melón

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 7

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
A través de la integración de información genómica, datos de secuenciación del transcriptoma y métodos bioinformáticos, realizamos una identificación exhaustiva de la familia de genes ALDH en el melón. Exploramos el impacto de esta familia de genes en el crecimiento y desarrollo del melón, así como sus patrones de expresión en varios tejidos y bajo diferentes condiciones de estrés. Nuestro estudio descubrió un total de 17 genes ALDH distribuidos en los cromosomas 1, 2, 3, 4, 5, 7, 8, 11 y 12 en el genoma del melón. A través de un análisis filogenético, estos genes fueron clasificados en 10 subfamilias distintas. Notablemente, los genes dentro de la misma subfamilia exhibieron estructuras genéticas consistentes y motivos conservados. Nuestro estudio descubrió un par de duplicaciones fragmentarias dentro del gen ALDH del melón. Además, hubo una relación de colinealidad notable entre el gen ALDH del melón y el de (12 veces), y el arroz (3 veces). La reanálisis de datos del transcriptoma reveló que algunos genes ALDH se expresaron consistentemente de manera alta en todos los tejidos y etapas de desarrollo, mientras que otros fueron específicos de tejido o etapa. Analizamos los patrones de expresión del gen ALDH bajo seis tipos de estrés, a saber, sal, frío, encharcamiento, oídio, marchitez y pudrición del tallo gomoso. Los resultados mostraron una expresión diferencial de y bajo todas las condiciones de estrés, lo que significa sus roles cruciales en el crecimiento del melón y la respuesta al estrés. El análisis de RT-qPCR (PCR cuantitativa de transcripción inversa) corroboró aún más estos hallazgos. Este estudio allana el camino para futuras mejoras genéticas en la cría molecular del melón.

Otros recursos que podrían interesarte

Temas Virtualpro