Gene family: identificación y caracterización a nivel genómico en , , y de la familia Malvaceae
Autores: Heidari, Parviz; Abdullah, ; Faraji, Sahar; Poczai, Peter
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2021
Acceso abierto
Artículo científico
2021
Gene family: identificación y caracterización a nivel genómico en , , y de la familia Malvaceae
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Agronomía y Ciencia de los Cultivos
Palabras clave
Magnesio
Genes MGT
Malvaceae
Genoma
Sistemas regulatorios
Red de co-expresión
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 30
Citaciones: Sin citaciones
El magnesio (Mg) es un elemento involucrado en varios procesos celulares clave en las plantas. Los genes transportadores de Mg (MGT) desempeñan un papel importante en la distribución de magnesio y el mantenimiento del equilibrio iónico. Aquí, se identificaron y caracterizaron miembros de la familia MGT en tres especies de la familia de plantas Malvaceae, , , y , para mejorar nuestra comprensión de su estructura, sistemas regulatorios, funciones e interacciones posibles. Identificamos 18, 41 y 16 genes no redundantes del genoma de , , y , respectivamente, que se agruparon en tres grupos en el árbol de máxima verosimilitud. Se determinaron varios eventos de duplicación segmentaria/tandémica entre genes. Parece que han evolucionado lentamente bajo una selección purificadora. El análisis de las regiones promotoras de los genes mostró que tienen un alto potencial para responder a estreses bióticos/abióticos y hormonas. Los patrones de expresión de los genes revelaron un posible papel en la respuesta a hongos en , mientras que los genes mostraron una expresión diferencial en varios tejidos y respuesta a varios estreses abióticos, incluyendo frío, sal, sequía y estrés por calor en . La red de co-expresión de los MGTs indicó que los genes involucrados en el metabolismo lipídico sensible a auxinas, la organización de la pared celular y la fotoprotección pueden interactuar con los MGTs.
Descripción
El magnesio (Mg) es un elemento involucrado en varios procesos celulares clave en las plantas. Los genes transportadores de Mg (MGT) desempeñan un papel importante en la distribución de magnesio y el mantenimiento del equilibrio iónico. Aquí, se identificaron y caracterizaron miembros de la familia MGT en tres especies de la familia de plantas Malvaceae, , , y , para mejorar nuestra comprensión de su estructura, sistemas regulatorios, funciones e interacciones posibles. Identificamos 18, 41 y 16 genes no redundantes del genoma de , , y , respectivamente, que se agruparon en tres grupos en el árbol de máxima verosimilitud. Se determinaron varios eventos de duplicación segmentaria/tandémica entre genes. Parece que han evolucionado lentamente bajo una selección purificadora. El análisis de las regiones promotoras de los genes mostró que tienen un alto potencial para responder a estreses bióticos/abióticos y hormonas. Los patrones de expresión de los genes revelaron un posible papel en la respuesta a hongos en , mientras que los genes mostraron una expresión diferencial en varios tejidos y respuesta a varios estreses abióticos, incluyendo frío, sal, sequía y estrés por calor en . La red de co-expresión de los MGTs indicó que los genes involucrados en el metabolismo lipídico sensible a auxinas, la organización de la pared celular y la fotoprotección pueden interactuar con los MGTs.