El trigo sarraceno tartario (Gaertn.) es un cultivo de grano grueso rico en flavonoides que son beneficiosos para la salud humana porque funcionan como antiinflamatorios y proporcionan protección contra enfermedades cardiovasculares y diabetes. La biosíntesis de flavonoides es un proceso complejo, y se conoce relativamente poco sobre las vías regulatorias involucradas en el trigo sarraceno tartario. Aquí, clonamos y caracterizamos el gen del trigo sarraceno tartario, que codifica un miembro de la familia de factores de transcripción R2R3-MYB. El análisis de la secuencia de aminoácidos y filogenético indica que FtMYB163 es un miembro del subgrupo 7 (SG7) y está estrechamente relacionado con FeMYBF1, que regula la síntesis de flavonoles en el trigo sarraceno común. Demostramos que FtMYB163 se localiza en el núcleo y tiene actividad transcripcional. Los niveles de expresión en las raíces, tallos, hojas, flores y semillas estaban correlacionados positivamente con los contenidos totales de flavonoides de estos tejidos. La sobreexpresión en transgénicos aumentó la expresión de varios genes involucrados en la biosíntesis temprana de flavonoides y aumentó significativamente la acumulación de varios flavonoides, incluyendo chalcona de naringenina, naringenina-7-O-glucósido, eriodictyol y ocho compuestos de flavonol. Nuestros hallazgos demuestran que FtMYB163 regula positivamente la biosíntesis de flavonoles al cambiar la expresión de varios genes clave en las vías biosintéticas de flavonoides.