BFT está estrechamente relacionado con la calidad de la carne y el porcentaje de carne magra en los cerdos. Los rasgos de BFT de los cerdos LW europeos difieren significativamente de los de los cerdos MZ indígenas grasos de China. CNV es una variación genética prevalente que juega un papel importante en rasgos económicamente importantes en los cerdos. Sin embargo, la contribución potencial de CNV a BFT en cerdos LW y MZ sigue siendo incierta. En este estudio, se realizó la detección de CNV en todo el genoma utilizando datos de secuenciación de nueva generación de cerdos LW y MZ, y se integraron datos de transcriptoma del tejido de grasa dorsal de cerdos LW y MZ de 180 días para el análisis de loci de rasgos cuantitativos de expresión (eQTL). Identificamos una variación en el número de copias en el gen asociado con BFT, mostrando un efecto de dosis entre los niveles del genoma y del transcriptoma del gen. En los preadipocitos porcinos, la expresión aumentó continuamente durante la diferenciación. La reducción de la expresión utilizando siRNA específico inhibió la diferenciación y proliferación de preadipocitos. Nuestro estudio proporciona información sobre la regulación genética de la calidad de la carne de cerdo y ofrece una base teórica para mejorar la calidad de la canal modulando BFT en los cerdos.