Gancho. El genoma contiene dos T-DNAs celulares con genes funcionales
Autores: Khafizova, Galina V.; Sierro, Nicolas; Ivanov, Nikolai V.; Sokornova, Sofie V.; Polev, Dmitrii E.; Matveeva, Tatiana V.
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Gancho. El genoma contiene dos T-DNAs celulares con genes funcionales
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Transformación
T-dna
Genes
CT-DNAs
Genoma
Expresión
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 11
Citaciones: Sin citaciones
La transformación mediada conduce a la formación de agallas en corona o raíces peludas en plantas infectadas. Estos efectos se desarrollan debido a la actividad de los genes T-DNA, reunidos en un gran plásmido, adquiridos de agrobacterias durante la transferencia horizontal de genes. Sin embargo, se sabe que muchas especies de plantas contienen tales secuencias, llamadas T-DNAs celulares (cT-DNAs), y mantienen fenotipos normales. Algunos de los genes permanecen intactos, lo que lleva a la conclusión de su papel funcional en las plantas. En este estudio, presentamos un análisis exhaustivo de los cT-DNAs en el genoma de Hook, incluyendo la expresión génica y la identificación de opinas. La secuenciación profunda del genoma reveló la presencia de dos T-DNAs diferentes, T-DNA1 y T-DNA2, que contienen los genes intactos. Según los resultados del análisis de expresión, todos estos genes son más activos en las raíces en comparación con otros órganos, lo cual es consistente con los datos sobre la expresión de genes cT-DNA en otras especies de plantas. También utilizamos enfoques de ingeniería genética y métodos de HPTLC y HPLC-MS para investigar el producto del gen (sintasa de agrocinopina), que resultó ser similar a la agrocinopina A. En general, este estudio amplía nuestro conocimiento sobre los cT-DNAs en las plantas y nos acerca a comprender sus posibles funciones. La investigación adicional de los cT-DNAs en diferentes especies y sus implicaciones funcionales podría contribuir a avances en la genética de plantas y potencialmente revelar rasgos novedosos con aplicaciones prácticas en la agricultura y otros campos.
Descripción
La transformación mediada conduce a la formación de agallas en corona o raíces peludas en plantas infectadas. Estos efectos se desarrollan debido a la actividad de los genes T-DNA, reunidos en un gran plásmido, adquiridos de agrobacterias durante la transferencia horizontal de genes. Sin embargo, se sabe que muchas especies de plantas contienen tales secuencias, llamadas T-DNAs celulares (cT-DNAs), y mantienen fenotipos normales. Algunos de los genes permanecen intactos, lo que lleva a la conclusión de su papel funcional en las plantas. En este estudio, presentamos un análisis exhaustivo de los cT-DNAs en el genoma de Hook, incluyendo la expresión génica y la identificación de opinas. La secuenciación profunda del genoma reveló la presencia de dos T-DNAs diferentes, T-DNA1 y T-DNA2, que contienen los genes intactos. Según los resultados del análisis de expresión, todos estos genes son más activos en las raíces en comparación con otros órganos, lo cual es consistente con los datos sobre la expresión de genes cT-DNA en otras especies de plantas. También utilizamos enfoques de ingeniería genética y métodos de HPTLC y HPLC-MS para investigar el producto del gen (sintasa de agrocinopina), que resultó ser similar a la agrocinopina A. En general, este estudio amplía nuestro conocimiento sobre los cT-DNAs en las plantas y nos acerca a comprender sus posibles funciones. La investigación adicional de los cT-DNAs en diferentes especies y sus implicaciones funcionales podría contribuir a avances en la genética de plantas y potencialmente revelar rasgos novedosos con aplicaciones prácticas en la agricultura y otros campos.