La vía de la autofagia selectiva, que conduce a la eliminación dirigida de componentes intracelulares específicos, está mediada por las proteínas ATG8, y se ha sugerido previamente que está involucrada en la regulación de la transición epitelio-mesenquimal (EMT) durante la etiología del cáncer. Sin embargo, los factores moleculares y los pasos de la autofagia selectiva que ocurren durante la EMT siguen siendo poco claros. Por lo tanto, analizamos una cohorte de tumores de adenocarcinoma de pulmón utilizando análisis de transcriptoma e inmunohistoquímica, y encontramos que la expresión de genes está correlacionada con la de genes relacionados con la EMT, y que los niveles de proteína GABARAPL1 están aumentados en tumores EMT+ en comparación con los EMT-. De manera similar, la inducción de EMT en la línea celular de adenocarcinoma de pulmón A549 utilizando TGF-beta/TNF-alfa llevó a un alto aumento en la expresión de GABARAPL1 mediado por los factores de transcripción relacionados con la EMT de la familia SMAD, mientras que los otros genes ATG8 fueron menos modificados. Para determinar el papel de GABARAPL1 durante la EMT, utilizamos la tecnología CRISPR/Cas9 en las líneas celulares de adenocarcinoma de riñón A549 y ACHN para eliminar GABARAPL1. Luego observamos que la eliminación de GABARAPL1 inducía EMT vinculada a un defecto de degradación mediada por GABARAPL1 de las proteínas SMAD. Estos hallazgos sugieren que, durante la EMT, GABARAPL1 podría intervenir en un bucle regulador de la EMT. De hecho, la inducción de EMT llevó a un aumento en los niveles de GABARAPL1 a través de la activación de la vía de señalización SMAD, y luego GABARAPL1 indujo la degradación selectiva por autofagia de las proteínas SMAD, lo que llevó a la inhibición de la EMT.