El establecimiento de simbiosis entre las raíces de las plantas desencadena la preparación de las respuestas de defensa, entre otros efectos. Actualmente, no hay evidencia clara sobre los mecanismos moleculares que permiten a la planta mantenerse alerta ante futuros estímulos, ya sea por ataque de patógenos o cualquier otro estrés abiótico. Las modificaciones epigenéticas han surgido como una estrategia para explicar el aumento de la respuesta de defensa de las plantas en un estado de preparación conferido por. Recientemente, se han identificado varias estructuras no canónicas de ácidos nucleicos, especialmente las estructuras de G-cuádruplex (G-cuádruplexes o G4s), como posibles objetivos durante el establecimiento o mantenimiento de las señales en las plantas. En el presente estudio, desarrollamos una prueba de cribado para la identificación de secuencias potencialmente formadoras de G4 (PQSs) en genes de preparación previamente identificados. El análisis bioinformático reveló la presencia de PQSs en la región promotora de cinco genes esenciales que desempeñan un papel crítico en la preparación en maíz. Estudios biofísicos y de espectroscopía mostraron la formación de G4s por estas PQSs in vitro, y ensayos de ChIP demuestran su formación in vivo. Por lo tanto, la formación de G4 podría desempeñar un papel como un mecanismo regulador epigenético involucrado en el estado preparado de larga duración en plantas de maíz.