El estrés por sequía impone severas restricciones en el crecimiento y rendimiento de los cultivos. Los factores de transcripción NAC (TF) juegan un papel fundamental en la regulación de las respuestas al estrés en las plantas. Sin embargo, las funciones biológicas y los mecanismos regulatorios de muchos NACs de algodón no han sido explorados. En este estudio, informamos sobre la clonación y caracterización de un gen que codifica un típico TF NAC de algodón. La expresión de este gen fue inducida por tratamiento con PEG, estrés por sequía y tratamiento con ABA. Además, investigamos su función utilizando el método de silenciamiento génico inducido por virus (VIGS). Las plantas silenciadas mostraron un estado de crecimiento más pobre bajo condiciones de estrés por sequía en comparación con los controles. Las plantas de algodón silenciadas tenían un menor contenido relativo de agua en las hojas y de clorofila, y un mayor contenido de MDA en comparación con los controles bajo el tratamiento de sequía. Los niveles de actividad enzimática de superóxido dismutasa (SOD), peroxidasa (POD) y catalasa (CAT) en las plantas silenciadas fueron más bajos en comparación con los controles cuando se expusieron al estrés por sequía. Además, se observó la regulación a la baja de los genes relacionados con el estrés por sequía en el algodón silenciado. En conjunto, nuestra investigación revela que este gen juega un papel en la reacción del algodón al estrés por sequía al afectar la expresión de genes relacionados con el estrés por sequía. Los datos obtenidos de este estudio sientan las bases teóricas para una investigación más profunda sobre la función biológica y los mecanismos regulatorios de este gen.