Las cuevas marinas se caracterizan por una amplia variabilidad ambiental debido a la interacción entre los procesos marinos y continentales. Sus condiciones pueden definirse como extremas para los organismos que las habitan debido a la morfología cerrada, la falta de luz y la escasez de nutrientes. Por lo tanto, es necesario identificar indicadores ecológicos fiables para describir y evaluar las condiciones ambientales en estos hábitats, incluso más que en otros lugares. Esta revisión tiene como objetivo proporcionar el estado del arte relacionado con la aplicación de foraminíferos bentónicos como proxies en la caracterización (paleo)ecológica de diferentes hábitats de cuevas marinas. Se prestó especial atención a un proyecto de investigación centrado en cuevas marinas mediterráneas con diferentes características, como extensión, morfología, influencia de agua dulce, salinidad, tipo de sedimento, oxigenación y suministro de materia orgánica. Esta revisión tiene como objetivo ilustrar la fiabilidad de los foraminíferos como indicador ecológico y paleoecológico en estos hábitats. Responden a diversas condiciones ambientales con diferentes ensamblajes que corresponden a una partición de hábitat muy detallada. Dado que las cuevas marinas pueden considerarse laboratorios naturales para la variabilidad ambiental, los resultados de estos estudios pueden interpretarse en la perspectiva de la variabilidad global para comprender los factores ambientales de los cambios futuros en los sistemas marinos.