Los hongos como heterótrofos son participantes clave en la descomposición de materiales orgánicos y la transformación de nutrientes en agroecosistemas. El retorno de paja enterrada en zanjas como una nueva estrategia de manejo de conservación puede mejorar la fertilidad del suelo y alterar los procesos hidrotermales. Sin embargo, cómo las estrategias de retorno de paja enterrada en zanjas afectan a la comunidad fúngica del suelo aún no está claro. En este sentido, se llevó a cabo un ensayo de campo de 7 años para probar las influencias de la profundidad de enterramiento (0, 10, 20, 30 y 40 cm) y la cantidad de paja enterrada en zanjas (media, completa, doble) sobre la diversidad, composición y funciones predichas de una comunidad fúngica del suelo, así como las actividades de las enzimas degradadoras de carbono. Bajo la cantidad completa de enterramiento de paja, la abundancia del filo fue un 7.5% mayor en comparación con otros tratamientos de cantidad de enterramiento. Esto aumentó aún más la actividad de la celobiohidrolasa en un 32%, como lo reveló la correlación positiva entre y celobiohidrolasa. Sin embargo, con un enterramiento de paja más profundo, la abundancia de y la actividad de beta-D-glucopiranósido disminuyeron. Además, el género y aumentaron mientras que disminuyó con la cantidad y profundidad de enterramiento de paja. La predicción mostró que los patógenos fúngicos de plantas eran de 1 a 2 veces más altos, mientras que los hongos micorrízicos arbusculares eran un 64% más bajos bajo la paja enterrada con el doble de cantidad y a una profundidad de 40 cm. En conjunto, estos hallazgos sugieren que el retorno de paja enterrada en zanjas con una cantidad completa y enterrada a una profundidad menor de 30 cm podría mejorar los ciclos de nutrientes del suelo y la salud, y puede ser beneficioso para la producción de cultivos subsiguientes.