La malignidad pancreática biliar tiene un inicio oculto, un alto grado de malignidad y un mal pronóstico. La mayoría de los pacientes clínicos pierden la oportunidad de una resección quirúrgica del tumor. La quimioterapia sistémica sigue siendo uno de los métodos importantes para el tratamiento de las malignidades pancreáticas biliares. Existen muchos regímenes de quimioterapia disponibles, pero su eficacia no es satisfactoria, y la aparición de resistencia a la quimioterapia es una de las principales razones que conducen a un mal pronóstico. Con el avance de los estudios sobre la flora intestinal, se ha encontrado que la flora intestinal está correlacionada y juega un papel importante en la resistencia a la quimioterapia. La aplicación de probióticos y otras formas de regular la flora intestinal puede mejorar este problema. Este artículo tiene como objetivo revisar y analizar el progreso de la investigación sobre la flora intestinal en la resistencia a la quimioterapia de las malignidades pancreáticas biliares para proporcionar nuevas ideas para el tratamiento.