El problema de evaluar el impacto de la contaminación en áreas protegidas nos llevó a aplicar un método combinado de bioindicación y mapeo espacial de datos de fitoplancton de seis lagos en el Parque Nacional de la Naturaleza Burabay en el norte de Kazajistán. La cuestión de la planificación del monitoreo era bastante aguda para esta área homogénea en paisajes entre las estepas de Kulunda. El fitoplancton en cada uno de los seis lagos se recolectó en la temporada de verano de 2019 en un total de 54 estaciones de muestreo. En total, se encontraron 139 especies de algas y cianobacterias de siete filos taxonómicos en el fitoplancton del Parque Burabay durante el período de estudio. Tres filos fueron los más ricos en especies: diatomeas, algas verdes y cianobacterias. Basado en la riqueza de especies, abundancia y biomasa, así como en bioindicadores e índices calculados de contaminación orgánica y efectos tóxicos, el estado ecológico actual del lago se evaluó como influenciado por la contaminación, de tipo mesotrófico y con una alta capacidad de autolimpieza. El mapeo estadístico, calculado por la correlación de la composición de especies y categorías de indicadores, reveló las zonas de impacto antrópico ubicadas en las costas del lago, y el agua de los lagos como débilmente alcalina, clases de calidad 2-3. Se reveló un aumento en el número de cianobacterias en las comunidades costeras, lo que puede estar asociado con un aumento de la carga biogénica en los ecosistemas lacustres. Los resultados del análisis y mapeo de indicadores revelaron que dos factores principales regulaban el fitoplancton: la salinidad y la contaminación orgánica. Las fuentes de contaminación orgánica están mayormente asociadas con la entrada de sustancias desde la zona costera, donde se encuentran resorts, carreteras y asentamientos.