Este documento analiza las comunidades de fitoplancton en el Océano Pacífico Tropical Oriental frente a México (ETPOM) y el Golfo de California del Sur (SGC) durante el fuerte evento de El Niño de 2023/24. Se llevó a cabo un crucero de investigación multidisciplinario en el invierno de 2024, durante el cual se recopilaron datos hidrográficos de alta resolución y muestras de agua para determinaciones de células de fitoplancton en 33 sitios. Además, se obtuvieron datos satelitales para evaluar la temperatura de la superficie del mar y los niveles de clorofila. Se identificaron un total de 269 especies de fitoplancton, que comprenden ciento cincuenta diatomeas, ciento doce dinoflagelados, cinco silicoflagelados, un ciliado y una cianobacteria. Las especies dominantes incluyeron la diatomea, el dinoflagelado, el silicoflagelado y el ciliado. También se identificó la cianobacteria. En términos de abundancias totales, las diatomeas fueron las más prevalentes, con 224,900 células L, seguidas de los dinoflagelados con 104,520 células L, ciliados con 20,980 células L, cianobacterias con 1760 células L y silicoflagelados con 1500 células L. Notablemente, surgieron diferencias interesantes en la riqueza de especies y la abundancia al comparar ambas regiones. Estos resultados mejoran nuestra comprensión de la dinámica del fitoplancton asociada con eventos fuertes de El Niño. El ETPOM sigue siendo una región que requiere un mayor monitoreo a través de observaciones in situ.