La fisiología comparativa y el análisis del transcriptoma proporcionan información sobre el mecanismo regulador del albinismo
Autores: Qian, Qixia; Ye, Quanfeng; Xu, Yin; Vasupalli, Naresh; Lu, Haiwen; Hu, Qiutao; Hou, Dan
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
La fisiología comparativa y el análisis del transcriptoma proporcionan información sobre el mecanismo regulador del albinismo
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Albinismo
Cultivo de tejidos
Cloroplastos
Análisis del transcriptoma
Biosíntesis de pigmentos
Factores de transcripción
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 11
Citaciones: Sin citaciones
El albinismo es un problema único que se encuentra en experimentos de cultivo de tejidos, pero el mecanismo subyacente sigue siendo poco claro en la mayoría de las especies de bambú. En este estudio, identificamos los genes reguladores putativos en un mutante albino utilizando fisiología comparativa y análisis de transcriptoma. Se observaron la degeneración de cloroplastos, bajo contenido de clorofila (Chl) y capacidad fotosintética reducida en líneas albinóticas en comparación con líneas normales. Se identificaron un total de 6191 unigenes que se expresaron de manera diferencial entre líneas albinas y normales mediante secuenciación de transcriptoma. La mayoría de los genes relacionados con el desarrollo de cloroplastos (como , ) y la biosíntesis de pigmentos (como , , ) se downregularon significativamente en líneas albinóticas, lo que podría ser responsable del fenotipo albino. Además, se identificaron algunos factores de transcripción (TFs) como PIF y GLK1 que están involucrados en el desarrollo de cloroplastos y la síntesis de Chl, lo que indica la participación de vías regulatorias putativas en albinóticos. Finalmente, la downregulación de algunos TFs sensibles al estrés (como ICE1 y EREB1) sugiere una reducción en la resistencia al estrés de los albinóticos. Los hallazgos anteriores proporcionaron nuevas perspectivas sobre el mecanismo molecular del albinismo en el bambú.
Descripción
El albinismo es un problema único que se encuentra en experimentos de cultivo de tejidos, pero el mecanismo subyacente sigue siendo poco claro en la mayoría de las especies de bambú. En este estudio, identificamos los genes reguladores putativos en un mutante albino utilizando fisiología comparativa y análisis de transcriptoma. Se observaron la degeneración de cloroplastos, bajo contenido de clorofila (Chl) y capacidad fotosintética reducida en líneas albinóticas en comparación con líneas normales. Se identificaron un total de 6191 unigenes que se expresaron de manera diferencial entre líneas albinas y normales mediante secuenciación de transcriptoma. La mayoría de los genes relacionados con el desarrollo de cloroplastos (como , ) y la biosíntesis de pigmentos (como , , ) se downregularon significativamente en líneas albinóticas, lo que podría ser responsable del fenotipo albino. Además, se identificaron algunos factores de transcripción (TFs) como PIF y GLK1 que están involucrados en el desarrollo de cloroplastos y la síntesis de Chl, lo que indica la participación de vías regulatorias putativas en albinóticos. Finalmente, la downregulación de algunos TFs sensibles al estrés (como ICE1 y EREB1) sugiere una reducción en la resistencia al estrés de los albinóticos. Los hallazgos anteriores proporcionaron nuevas perspectivas sobre el mecanismo molecular del albinismo en el bambú.