Análisis filogenético de la familia de genes en Euphorbiaceae y sus perfiles de expresión en el árbol de tung ()
Autores: Yang, Chengbo; Yi, Yaqi; Wang, Jiabei; Ge, Liu; Zhang, Lin; Liu, Meilan
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Análisis filogenético de la familia de genes en Euphorbiaceae y sus perfiles de expresión en el árbol de tung ()
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Proteína relacionada con la patogénesis-4
árbol de tung
Genes
Perfiles de expresión
Elementos cis del promotor
Análisis filogenético
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 11
Citaciones: Sin citaciones
La proteína relacionada con la patogénesis-4 se cree generalmente que está involucrada en procesos fisiológicos. Sin embargo, aún no se ha realizado una investigación exhaustiva de esta proteína en el árbol de tung. En este estudio, identificamos 30 genes en los genomas de especies de Euphorbiaceae e investigamos su organización de dominios, evolución, elementos cis del promotor, perfiles de expresión y perfiles de expresión en el árbol de tung. Los análisis de secuencia y estructura indicaron que en el árbol de tung podrían clasificarse como pertenecientes a la Clase II y I, respectivamente. Los análisis filogenéticos y de Ka/Ks revelaron que exhibió un número significativamente expandido de genes. Además, el análisis de elementos cis del promotor sugirió que dos genes pueden desempeñar un papel en la respuesta a hormonas y estrés biótico y abiótico de los árboles de tung. Además, se evaluaron los patrones de expresión de los genes y sus respuestas a 6-BA, ácido salicílico y nitrato de plata en los brotes de inflorescencia de los árboles de tung utilizando qRT-PCR. Notablemente, se encontró que la expresión de dos genes era particularmente alta en las hojas y en las primeras etapas de las semillas de tung. Estos resultados sugieren que y pueden tener roles significativos en el desarrollo de hojas y semillas en los árboles de tung. Además, se encontró que estos genes eran sensibles a 6-BA, ácido salicílico y nitrato de plata en el desarrollo de los brotes de inflorescencia. Esta investigación proporciona valiosos conocimientos para futuras investigaciones sobre las funciones de los genes en los árboles de tung.
Descripción
La proteína relacionada con la patogénesis-4 se cree generalmente que está involucrada en procesos fisiológicos. Sin embargo, aún no se ha realizado una investigación exhaustiva de esta proteína en el árbol de tung. En este estudio, identificamos 30 genes en los genomas de especies de Euphorbiaceae e investigamos su organización de dominios, evolución, elementos cis del promotor, perfiles de expresión y perfiles de expresión en el árbol de tung. Los análisis de secuencia y estructura indicaron que en el árbol de tung podrían clasificarse como pertenecientes a la Clase II y I, respectivamente. Los análisis filogenéticos y de Ka/Ks revelaron que exhibió un número significativamente expandido de genes. Además, el análisis de elementos cis del promotor sugirió que dos genes pueden desempeñar un papel en la respuesta a hormonas y estrés biótico y abiótico de los árboles de tung. Además, se evaluaron los patrones de expresión de los genes y sus respuestas a 6-BA, ácido salicílico y nitrato de plata en los brotes de inflorescencia de los árboles de tung utilizando qRT-PCR. Notablemente, se encontró que la expresión de dos genes era particularmente alta en las hojas y en las primeras etapas de las semillas de tung. Estos resultados sugieren que y pueden tener roles significativos en el desarrollo de hojas y semillas en los árboles de tung. Además, se encontró que estos genes eran sensibles a 6-BA, ácido salicílico y nitrato de plata en el desarrollo de los brotes de inflorescencia. Esta investigación proporciona valiosos conocimientos para futuras investigaciones sobre las funciones de los genes en los árboles de tung.