Filogenia y Divergencia Genética entre Aislados del Virus del Mosaicismo del Sorgo que Infectan la Caña de Azúcar
Autores: Xu, Hui-Mei; He, Er-Qi; Yang, Zu-Li; Bi, Zheng-Wang; Bao, Wen-Qing; Sun, Sheng-Ren; Lu, Jia-Ju; Gao, San-Ji
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Filogenia y Divergencia Genética entre Aislados del Virus del Mosaicismo del Sorgo que Infectan la Caña de Azúcar
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Virus del mosaico del sorgo
SrMV
Caña de azúcar
RT-PCR
Análisis filogenético
Diferenciación genética
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 9
Citaciones: Sin citaciones
El virus del mosaico del sorgo (SrMV, del género de la familia) es un agente causal del mosaico común en la caña de azúcar y representa una amenaza para la industria azucarera global. En este estudio, se recolectaron un total de 901 muestras de hojas de caña de azúcar con síntomas de mosaico de ocho provincias en China y se detectaron mediante RT-PCR utilizando un par de primers específicos para la proteína de la cápside de SrMV. Estas muestras de hojas incluyeron 839 muestras de cultivares modernos (híbridos de spp.) y 62 muestras de caña de masticar. De estas, 632 de 901 (70.1%) muestras dieron positivo para SrMV. Las incidencias de infección por SrMV fueron del 72.3% y 40.3% en cultivares modernos y caña de masticar, respectivamente. El análisis filogenético mostró que todos los aislados de SrMV analizados se agruparon en tres clados que consisten en seis grupos filogenéticos basados en 306 secuencias (este estudio = 265 y base de datos de GenBank = 41). Un total de 10 aislados de SrMV de América del Sur (Estados Unidos y Argentina) junto con 106 aislados de China se agruparon en el grupo D, mientras que los 190 aislados restantes de SrMV de Asia (China y Vietnam) se dispersaron en cinco grupos. Los aislados de SrMV en el grupo F se limitaron a la provincia de Yunnan en China, y los del grupo A se distribuyeron en ocho provincias. Se elucidó una heterogeneidad genética significativa en las identidades de secuencia de nucleótidos de todas las CPs de SrMV, que varían del 69.0% al 100%. Se postuló un evento de recombinación potencial entre los aislados de SrMV basado en secuencias. Todos los SrMV analizados sufrieron una selección negativa dominante. El aislamiento geográfico (América del Sur vs. Asia) y los tipos de hospedadores (cultivares modernos vs. caña de masticar) son factores importantes que promueven la diferenciación genética de las poblaciones de SrMV. En general, este estudio contribuye a la comprensión global de la evolución genética de SrMV y proporciona un recurso valioso para la epidemiología y el manejo del mosaico en la caña de azúcar.
Descripción
El virus del mosaico del sorgo (SrMV, del género de la familia) es un agente causal del mosaico común en la caña de azúcar y representa una amenaza para la industria azucarera global. En este estudio, se recolectaron un total de 901 muestras de hojas de caña de azúcar con síntomas de mosaico de ocho provincias en China y se detectaron mediante RT-PCR utilizando un par de primers específicos para la proteína de la cápside de SrMV. Estas muestras de hojas incluyeron 839 muestras de cultivares modernos (híbridos de spp.) y 62 muestras de caña de masticar. De estas, 632 de 901 (70.1%) muestras dieron positivo para SrMV. Las incidencias de infección por SrMV fueron del 72.3% y 40.3% en cultivares modernos y caña de masticar, respectivamente. El análisis filogenético mostró que todos los aislados de SrMV analizados se agruparon en tres clados que consisten en seis grupos filogenéticos basados en 306 secuencias (este estudio = 265 y base de datos de GenBank = 41). Un total de 10 aislados de SrMV de América del Sur (Estados Unidos y Argentina) junto con 106 aislados de China se agruparon en el grupo D, mientras que los 190 aislados restantes de SrMV de Asia (China y Vietnam) se dispersaron en cinco grupos. Los aislados de SrMV en el grupo F se limitaron a la provincia de Yunnan en China, y los del grupo A se distribuyeron en ocho provincias. Se elucidó una heterogeneidad genética significativa en las identidades de secuencia de nucleótidos de todas las CPs de SrMV, que varían del 69.0% al 100%. Se postuló un evento de recombinación potencial entre los aislados de SrMV basado en secuencias. Todos los SrMV analizados sufrieron una selección negativa dominante. El aislamiento geográfico (América del Sur vs. Asia) y los tipos de hospedadores (cultivares modernos vs. caña de masticar) son factores importantes que promueven la diferenciación genética de las poblaciones de SrMV. En general, este estudio contribuye a la comprensión global de la evolución genética de SrMV y proporciona un recurso valioso para la epidemiología y el manejo del mosaico en la caña de azúcar.