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Relaciones filogenéticas y adaptación a gran altitud en jabalíes (), identificadas utilizando datos genómicos a gran escala

Autores: Fang, Shiyong; Zhang, Haoyuan; Long, Haoyuan; Zhang, Dongjie; Chen, Hongyue; Yang, Xiuqin; Pan, Hongmei; Pan, Xiao; Liu, Di; E, Guangxin

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2024

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Acceso abierto

Artículo científico
2024

Relaciones filogenéticas y adaptación a gran altitud en jabalíes (), identificadas utilizando datos genómicos a gran escala


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Zootecnia

Palabras clave

Jabalíes
Adaptación a gran altitud
Datos genómicos
Cdgs
Islas roh

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 12

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
El jabalí del Plateau Qinghai-Tíbet (QTP) es un excelente modelo para investigar la adaptación a gran altitud. En este estudio, analizamos datos genómicos de 93 jabalíes recopilados de varios estudios en todo el mundo, incluidos el QTP, las regiones del sur y del norte de China, Europa, Asia del Este y Asia del Sudeste, para explorar sus patrones filogenéticos y la adaptación a gran altitud basada en el análisis de señales de selección a nivel genómico y la estimación de la corrida de homocigosidad (ROH). Los hallazgos demuestran la alineación entre las asociaciones filogenéticas entre los jabalíes y su ubicación geográfica. Un análisis de ADMIXTURE indicó una relación genética relativamente cercana entre los jabalíes del QTP y los del sur de China. Los análisis del índice de fijación y la homocigosidad de haplotipos extendidos entre poblaciones revelaron 295 genes candidatos (CDGs) asociados con la adaptación a gran altitud, como , , , y . Estos CDGs estaban significativamente sobrerrepresentados en vías como la señalización del objetivo mamífero de la rapamicina y las vías de anemia de Fanconi. Además, se descubrieron 39 islas de ROH y numerosos CDGs selectivos (por ejemplo, , , y ), que están implicados en el metabolismo de la glucosa y la función mitocondrial, en jabalíes del QTP. Este estudio no solo evaluó la historia filogenética de los jabalíes del QTP, sino que también avanzó nuestra comprensión de los mecanismos genéticos subyacentes a la adaptación de los jabalíes a grandes altitudes.

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