Relaciones filogenéticas y adaptación a gran altitud en jabalíes (), identificadas utilizando datos genómicos a gran escala
Autores: Fang, Shiyong; Zhang, Haoyuan; Long, Haoyuan; Zhang, Dongjie; Chen, Hongyue; Yang, Xiuqin; Pan, Hongmei; Pan, Xiao; Liu, Di; E, Guangxin
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Relaciones filogenéticas y adaptación a gran altitud en jabalíes (), identificadas utilizando datos genómicos a gran escala
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Zootecnia
Palabras clave
Jabalíes
Adaptación a gran altitud
Datos genómicos
Cdgs
Islas roh
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 12
Citaciones: Sin citaciones
El jabalí del Plateau Qinghai-Tíbet (QTP) es un excelente modelo para investigar la adaptación a gran altitud. En este estudio, analizamos datos genómicos de 93 jabalíes recopilados de varios estudios en todo el mundo, incluidos el QTP, las regiones del sur y del norte de China, Europa, Asia del Este y Asia del Sudeste, para explorar sus patrones filogenéticos y la adaptación a gran altitud basada en el análisis de señales de selección a nivel genómico y la estimación de la corrida de homocigosidad (ROH). Los hallazgos demuestran la alineación entre las asociaciones filogenéticas entre los jabalíes y su ubicación geográfica. Un análisis de ADMIXTURE indicó una relación genética relativamente cercana entre los jabalíes del QTP y los del sur de China. Los análisis del índice de fijación y la homocigosidad de haplotipos extendidos entre poblaciones revelaron 295 genes candidatos (CDGs) asociados con la adaptación a gran altitud, como , , , y . Estos CDGs estaban significativamente sobrerrepresentados en vías como la señalización del objetivo mamífero de la rapamicina y las vías de anemia de Fanconi. Además, se descubrieron 39 islas de ROH y numerosos CDGs selectivos (por ejemplo, , , y ), que están implicados en el metabolismo de la glucosa y la función mitocondrial, en jabalíes del QTP. Este estudio no solo evaluó la historia filogenética de los jabalíes del QTP, sino que también avanzó nuestra comprensión de los mecanismos genéticos subyacentes a la adaptación de los jabalíes a grandes altitudes.
Descripción
El jabalí del Plateau Qinghai-Tíbet (QTP) es un excelente modelo para investigar la adaptación a gran altitud. En este estudio, analizamos datos genómicos de 93 jabalíes recopilados de varios estudios en todo el mundo, incluidos el QTP, las regiones del sur y del norte de China, Europa, Asia del Este y Asia del Sudeste, para explorar sus patrones filogenéticos y la adaptación a gran altitud basada en el análisis de señales de selección a nivel genómico y la estimación de la corrida de homocigosidad (ROH). Los hallazgos demuestran la alineación entre las asociaciones filogenéticas entre los jabalíes y su ubicación geográfica. Un análisis de ADMIXTURE indicó una relación genética relativamente cercana entre los jabalíes del QTP y los del sur de China. Los análisis del índice de fijación y la homocigosidad de haplotipos extendidos entre poblaciones revelaron 295 genes candidatos (CDGs) asociados con la adaptación a gran altitud, como , , , y . Estos CDGs estaban significativamente sobrerrepresentados en vías como la señalización del objetivo mamífero de la rapamicina y las vías de anemia de Fanconi. Además, se descubrieron 39 islas de ROH y numerosos CDGs selectivos (por ejemplo, , , y ), que están implicados en el metabolismo de la glucosa y la función mitocondrial, en jabalíes del QTP. Este estudio no solo evaluó la historia filogenética de los jabalíes del QTP, sino que también avanzó nuestra comprensión de los mecanismos genéticos subyacentes a la adaptación de los jabalíes a grandes altitudes.