El Tonnoidea Suter, 1913 (1825) es un grupo moderadamente diverso de grandes gasterópodos depredadores, cuya sistemática sigue siendo poco clara. En el presente estudio, se secuenciaron los genomas mitocondriales completos de nueve especies tonnoideas. Todos los mitogenomas recién secuenciados contienen 13 genes que codifican proteínas (PCGs), 22 genes de ARN de transferencia y dos genes de ARN ribosómico, mostrando patrones similares en tamaño del genoma, orden de los genes y composición de nucleótidos. La relación de no sinónimos a sinónimos de los PCGs indicó que los genes del complejo NADH de los tonnoideos estaban experimentando una selección purificadora más relajada en comparación con los genes COX. La filogenia reconstruida basada en las secuencias de aminoácidos combinadas de 13 genes que codifican proteínas y las secuencias nucleotídicas de dos genes de rRNA apoyó que Ficidae Meek, 1864 (1840) es un grupo hermano de Tonnoidea. Se recuperaron las monofilias de todas las familias tonnoideas y las relaciones filogenéticas internas fueron consistentes con la clasificación actual. La filogenia también reveló que (Linnaeus, 1758) está compuesta por al menos dos especies diferentes, lo que indica que la diversidad de especies dentro de Bursidae Thiele, 1925 podría estar subestimada. El presente estudio contribuye a la comprensión de la sistemática tonnoidea y podría proporcionar información importante para la revisión de la sistemática tonnoidea en el futuro.