El selenio (Se) es un nutriente cuya ingesta diaria a menudo está por debajo de los niveles recomendados en las personas. La biofortificación con Se es un método para aumentar esta ingesta al elevar la concentración de Se en los frutos de tomate, un efecto dependiente de las fuentes y modos de aplicación. Además, la aplicación de Se puede promover la mejora de otros compuestos en los frutos de tomate, alterando su metabolismo, lo que puede aumentar la vida útil de la fruta. Este estudio tuvo como objetivo determinar cómo diferentes estrategias de aplicación de un fertilizante multi-nutriente que contiene Se (SeMNF) pueden aumentar el contenido de Se y otros compuestos bioactivos y mejorar la vida útil de los frutos de tomate (L.). Se evaluaron diferentes estrategias de fertilización foliar que involucraban el uso de SeMNF en ensayos de campo realizados en cultivos comerciales de tomate. Se utilizaron tomates de crecimiento indeterminado y se probaron diferentes dosis de Se y estrategias de aplicación. La cosecha se realizó en tres fases de acuerdo con la maduración de la fruta. Cada fruta cosechada se evaluó por el contenido de Se, macro y micronutrientes, compuestos fenólicos totales, vitamina C, actividad antioxidante, carotenoides, pH, acidez titulable total y sólidos solubles totales en los frutos de tomate. Dosis de 15 g ha de Se, divididas en tres aplicaciones, aumentaron el contenido de Se en las frutas en la primera y segunda cosecha. La aplicación de SeMNF a dosis de Se superiores a 10 g de Se ha aumentó la firmeza, los días de maduración y la calidad nutricional de los tomates (mayores contenidos de carotenoides (+39%), licopeno (+33%), actividad antioxidante (+16%), compuestos fenólicos totales (+38%) y vitamina C (+14%) en un efecto dependiente de la dosis de la estrategia de aplicación utilizada. Estos resultados contribuyeron a un aumento en la vida útil de los tomates, reduciendo así el desperdicio de alimentos.