El efecto de la fertilización mineral (NPK), la fertilización foliar con micronutrientes (Cu, Zn y Mn) y el bioestimulante NanoGro en la severidad de las enfermedades foliares, de espiga, de la base del tallo y de la raíz en la variedad de espelta de invierno cv. Schwabenkorn fue evaluado en un experimento de campo. Se realizó un análisis micológico y se determinó el contenido de micotoxinas de Fusarium en el grano. La fertilización mineral (NPK), la fertilización foliar con micronutrientes y el bioestimulante NanoGro ejercieron efectos variados en la severidad de la mancha foliar de Septoria y la mancha de la gluma de Septoria, promovieron la propagación de la roya parda (excluyendo el tratamiento NPK + NanoGro) e inhibieron la propagación del moho de cabeza negra (excluyendo el tratamiento NPK), la mancha ocular y la pudrición de pie y raíz por Fusarium (excluyendo el tratamiento NPK + Mn). La fertilización no tuvo influencia en el rendimiento del grano o en el contenido de micotoxinas de Fusarium en el grano. Las concentraciones de deoxinivalenol (DON), nivalenol (NIV), zearalenona (ZEA) y fumonisinas FB + FB no superaron los niveles máximos permitidos (excepto para DON en los tratamientos NPK + Cu + Zn + Mn y NPK + NanoGro). A lo largo del experimento, las concentraciones de ergosterol (ERG) fueron más altas en el grano de las plantas de espelta no fertilizadas.