El manejo de la fertilización afecta tanto la productividad como el valor nutritivo de las leguminosas forrajeras. Sin embargo, hay pocos estudios sobre los cambios en los carbohidratos no estructurales de la alfalfa bajo fertilización a largo plazo. Los objetivos de este estudio fueron comparar los efectos de la fertilización mineral y el estiércol orgánico en las partes de la planta de alfalfa (hoja, tallo) acumulación de almidón y carbohidratos solubles en agua (WSC) en asociación con la estructura del dosel después de 60 años de diferentes enfoques de manejo de la fertilización. Los tratamientos investigados fueron: dos niveles contrastantes de aplicación de N mineral, PO y KO (0:0:0 y 91:71:175), cada uno con y sin estiércol de corral. Los cambios se reflejaron principalmente en el contenido de WSC donde la fertilización mineral intensiva redujo consistentemente el WSC del tallo y del forraje en contraste con el control sin fertilizar o solo con estiércol. Estos cambios podrían estar asociados con un efecto de dilución presentado por el mayor aumento de la longitud máxima del tallo en estos tratamientos. El estiércol mejoró el WSC de la hoja y del forraje a pesar del aumento asociado en la longitud máxima del tallo y la relación de peso de la hoja, probablemente como resultado de la mejora del ambiente del suelo junto con la presencia potencialmente aumentada de hongos micorrícicos arbusculares. Los resultados mostraron que la fertilización con estiércol tiene potencial para mejorar el WSC de la alfalfa, a pesar de algunas relaciones negativas entre los rasgos del dosel de la alfalfa y el contenido de azúcar.