Las células germinales primordiales (PGCs) son los precursores de los gametos. Debido a su importancia para la formación y reproducción de un organismo, entender los mecanismos y vías de las PGCs y las diferencias entre machos y hembras es esencial. Sin embargo, hay poca investigación en animales domésticos, por ejemplo, en cerdos, respecto a los perfiles epigenéticos y de pluripotencia de las PGCs durante el desarrollo. Este estudio analizó la expresión de marcadores epigenéticos y varios marcadores pluripotentes y de línea germinal asociados con el desarrollo y diferenciación de las PGCs porcinas (pPGCs), con el objetivo de entender los diferentes perfiles de expresión génica entre los géneros. El análisis de las gónadas en diferentes períodos gestacionales (de 24 a 35 días post fertilización (dpf) y en adultos) se evaluó mediante inmunofluorescencia y RT-qPCR y mostró diferencias fenotípicas entre las gónadas de embriones machos y hembras. Además, las pPGCs fueron positivas para OCT4 y VASA; algunas células fueron positivas para H3k27me3 en embriones machos y en testículos adultos. En adultos, las células de los testículos fueron positivas para marcadores de línea germinal, como se confirmó mediante el análisis de expresión génica. Los resultados pueden contribuir a entender las vías de las pPGC durante el desarrollo reproductivo, al mismo tiempo que contribuyen al conocimiento necesario para generar gametos maduros in vitro.