Implementamos técnicas de fenotipado de alto rendimiento (HTP) en el campo para adquirir datos de rasgos para un subconjunto de una población de líneas de sustitución de segmentos cromosómicos de maní (CSSL). Se utilizaron sensores montados en un vehículo aéreo no tripulado (UAV) para derivar varios índices vegetativos, así como temperaturas del dosel. Una combinación de imágenes aéreas y puntuaciones manuales mostró que CSSL 100, CSSL 84, CSSL 111 y CSSL 15 tenían una incidencia notablemente baja del virus del mosaico moteado del tomate (TSWV), una enfermedad devastadora en el sur de Georgia, EE. UU. Las cuatro líneas también se desempeñaron bien bajo presión de mancha foliar. Los índices vegetativos mostraron fuertes correlaciones de hasta 0.94 con puntuaciones visuales de enfermedades, lo que indica que el fenotipado aéreo es una forma confiable de seleccionar bajo presión de enfermedades. Dado que los componentes del rendimiento del maní están debajo de la superficie del suelo, implementamos la tecnología de radar de penetración terrestre (GPR) para detectar vainas de manera no destructiva. Se observaron correlaciones moderadas de hasta 0.5 entre el peso de las vainas y los datos adquiridos de las señales de GPR. Tanto los datos de vainas adquiridos manualmente como las variables de GPR destacaron las tres líneas, CSSL 84, CSSL 100 y CSSL 111, como las líneas de mejor rendimiento, con pesos de vainas comparables al control cultivado Tifguard. A través de la aplicación combinada de técnicas manuales y HTP, este estudio refuerza la premisa de que los segmentos cromosómicos de parientes silvestres del maní pueden ser una fuente potencial de rasgos agronómicos valiosos.