Los tratamientos tradicionales del cáncer han enfrentado varios desafíos, incluyendo toxicidad, resistencia a medicamentos y cargas financieras. Por otro lado, los fitoquímicos bioactivos empleados en la medicina alternativa complementaria han ganado interés recientemente debido a su capacidad para controlar una amplia gama de vías moleculares mientras son menos dañinos. Como resultado, utilizamos un enfoque de farmacología de redes para estudiar los posibles mecanismos regulatorios de los constituyentes activos para el tratamiento del cáncer de hígado (CH). Los constituyentes activos fueron recuperados de la base de datos IMPPAT y de la revisión de literatura, y sus objetivos fueron recuperados de las bases de datos STITCH y Swiss Target Prediction. Los objetivos relacionados con el CH fueron recuperados de conjuntos de datos de expresión (GSE39791, GSE76427, GSE22058, GSE87630 y GSE112790) a través de la base de datos de expresión de genes (GEO). La base de datos DAVID Gene Ontology (GO) se utilizó para anotar proteínas objetivo, mientras que la Enciclopedia de Kyoto y la base de datos del Genoma (KEGG) se utilizaron para analizar la enriquecimiento de vías de señalización. STRING y Cytoscape se utilizaron para crear redes de interacción proteína-proteína (PPI), mientras que el algoritmo de puntuación de grado de CytoHubba se utilizó para identificar genes clave. El servidor GEPIA2 se utilizó para el análisis de supervivencia, y PyRx se utilizó para el análisis de acoplamiento molecular. El análisis de supervivencia y de red reveló que cinco genes llamados proteína de choque térmico 90 AA1 (HSP90AA1), receptor de estrógeno 1 (ESR1), citocromo P450 3A4 (CYP3A4), quinasa dependiente de ciclina 1 (CDK1) y metaloproteinasa de matriz-9 (MMP9) están relacionados con la supervivencia de los pacientes con CH. Finalmente, concluimos que cuatro ingredientes extremadamente activos, a saber, cosmosiína, ácido rosmarínico, quercetina y rubinina, influyen en la expresión de HSP90AA1, que puede servir como un posible objetivo terapéutico para el CH. Estos resultados fueron validados además por un análisis de simulación de dinámica molecular, que predijo los complejos con dinámicas altamente estables. Los residuos de la proteína objetivo mostraron una naturaleza altamente estable, excepto por el dominio N-terminal sin afectar la unión del fármaco. Un estudio integrado de farmacología de redes y acoplamiento demostró que tenía un efecto preventivo prometedor sobre el CH al trabajar en vías de señalización relacionadas con el cáncer.